概括
基因 5264
象征 Phyh
同义词 ln1 | lnap1 | pahx | phyh1 | rd
描述 植物-COA 2-羟化酶
参考 MIM:602026|HGNC:HGNC:8940|ENSEMBL:ENSG00000107537|HPRD:03609|Vega:Otthumg0000000017693
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p13
Pascal P值 0.459
Sherlock P值 0.69
主持人 小脑半球
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TRIM46 0.93 0.96
Gprin1 0.93 0.96
PACS1 0.93 0.96
SARM1 0.92 0.96
DTX1 0.92 0.93
FAM171A2 0.92 0.94
strn4 0.91 0.95
SRD5A1 0.91 0.93
KCTD13 0.91 0.93
gramd1a 0.91 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.77 -0.85
AF347015.31 -0.77 -0.84
AF347015.33 -0.76 -0.83
AF347015.27 -0.76 -0.83
mt-cyb -0.74 -0.82
S100B -0.74 -0.81
AF347015.8 -0.74 -0.84
AC021016.1 -0.72 -0.84
FXYD1 -0.72 -0.79
HLA-F -0.71 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005506 铁离子结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0009055 电子载体活动 塔斯 8954107
GO:0031418 L-抗坏血酸结合 IEA -
GO:0048244 植酮-COA二氧酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 9326940
去:0007605 声音的感官感知 IEA -
去:0007601 视觉感知 IEA -
去:0006629 脂质代谢过程 塔斯 8954107
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
GO:0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005777 过氧化物酶体 塔斯 8954107

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg过氧化物酶体 78 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组过氧化物酶体脂质代谢 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis乳腺癌进展DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌遗传与零星 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gajate对trabectedin的反应 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ellwood Myc Targets DN 40 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因