基因页:pigh
概括?
基因 | 5283 |
象征 | pigh |
同义词 | GPI-H |
描述 | 磷脂酰肌醇聚糖锚固生物合成类H |
参考 | MIM:600154|HGNC:HGNC:8964|Ensembl:ENSG00000100564|HPRD:02540|Vega:Otthumg00000171806 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q24.1 |
Pascal P值 | 0.972 |
Sherlock P值 | 0.847 |
胎儿β | -0.037 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 皮质 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG12648263 | 14 | 68067090 | pigh | -0.028 | 0.27 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PIGH_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PSAP | 0.89 | 0.89 |
ABHD12 | 0.87 | 0.89 |
鼻烟 | 0.87 | 0.89 |
GHITM | 0.87 | 0.90 |
COPS7A | 0.87 | 0.88 |
Tom1 | 0.87 | 0.88 |
PGK1 | 0.86 | 0.87 |
CTSD | 0.86 | 0.87 |
SLC25A4 | 0.86 | 0.87 |
TMX2 | 0.86 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC005921.3 | -0.47 | -0.58 |
AC010300.1 | -0.45 | -0.49 |
ZNF814 | -0.43 | -0.48 |
AC135724.1 | -0.42 | -0.46 |
FAM159B | -0.42 | -0.54 |
IL3RA | -0.41 | -0.56 |
EIF5B | -0.41 | -0.45 |
ankrd36 | -0.40 | -0.49 |
KCNMB3 | -0.40 | -0.38 |
ankrd36b | -0.39 | -0.48 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖基磷脂酰肌醇GPI锚固生物合成 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的翻译后修饰合成GPI锚定蛋白 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组合成糖基磷脂酰肌醇GPI | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
takao对UVB辐射的响应 | 86 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Coulouarn暂时TGFB1签名 | 109 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |