基因页:PIK3C2A
概括?
基因 | 5286 |
象征 | PIK3C2A |
同义词 | cpk | pi3-k-c2(alpha)| pi3-k-c2a |
描述 | 磷脂酰肌醇-4-磷酸3-激酶催化亚基2型α |
参考 | MIM:603601|HGNC:HGNC:8971|ENSEMBL:ENSG00000011405|HPRD:04672|Vega:Otthumg00000166036 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.5-P14 |
Pascal P值 | 2.217E-4 |
胎儿β | 0.937 |
主持人 | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | PIK3C2A | 5286 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PIK3C2A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NRP1 | 0.75 | 0.75 |
LATS2 | 0.71 | 0.46 |
TRPC6 | 0.70 | 0.78 |
FNDC1 | 0.65 | 0.71 |
ZNF215 | 0.65 | 0.74 |
TSHR | 0.65 | 0.24 |
ptprg | 0.63 | 0.72 |
SEZ6L | 0.62 | 0.75 |
itga4 | 0.62 | 0.67 |
NRP2 | 0.62 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.44 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.44 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.42 | -0.62 |
mt-cyb | -0.42 | -0.63 |
AF347015.8 | -0.41 | -0.64 |
AF347015.2 | -0.41 | -0.63 |
AF347015.21 | -0.41 | -0.66 |
AF347015.27 | -0.41 | -0.60 |
higd1b | -0.40 | -0.61 |
AF347015.15 | -0.40 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG肌醇磷酸代谢 | 54 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AVB3整合素途径 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
早期内体膜上PIPS的反应组合成 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在高尔基膜上的PIPS合成反应组合成 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在晚期内体膜上PIPS的反应组合成 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
质膜上的PIP的反应组合成 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pi代谢 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1和DCC目标 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN | 88 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN | 84 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BILD CTNNB1致癌特征 | 82 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zembutsu对阿霉素的敏感性 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BMP7的Zhang脂肪形成 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |