概括
基因 5286
象征 PIK3C2A
同义词 cpk | pi3-k-c2(alpha)| pi3-k-c2a
描述 磷脂酰肌醇-4-磷酸3-激酶催化亚基2型α
参考 MIM:603601|HGNC:HGNC:8971|ENSEMBL:ENSG00000011405|HPRD:04672|Vega:Otthumg00000166036
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5-P14
Pascal P值 2.217E-4
胎儿β 0.937
主持人 尾状基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 PIK3C2A 5286 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NRP1 0.75 0.75
LATS2 0.71 0.46
TRPC6 0.70 0.78
FNDC1 0.65 0.71
ZNF215 0.65 0.74
TSHR 0.65 0.24
ptprg 0.63 0.72
SEZ6L 0.62 0.75
itga4 0.62 0.67
NRP2 0.62 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.44 -0.68
AF347015.31 -0.44 -0.66
AF347015.33 -0.42 -0.62
mt-cyb -0.42 -0.63
AF347015.8 -0.41 -0.64
AF347015.2 -0.41 -0.63
AF347015.21 -0.41 -0.66
AF347015.27 -0.41 -0.60
higd1b -0.40 -0.61
AF347015.15 -0.40 -0.62

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肌醇磷酸代谢 54 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 60 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
早期内体膜上PIPS的反应组合成 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在高尔基膜上的PIPS合成反应组合成 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在晚期内体膜上PIPS的反应组合成 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
质膜上的PIP的反应组合成 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pi代谢 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1和DCC目标 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1致癌特征 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zembutsu对阿霉素的敏感性 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BMP7的Zhang脂肪形成 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因