概括
基因 5289
象征 PIK3C3
同义词 VPS34 | VPS34 | HVPS34
描述 磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基3型
参考 MIM:602609|HGNC:HGNC:8974|HPRD:04009|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q12.3
Pascal P值 0.123
Sherlock P值 0.438
胎儿β 0.429
主持人 小脑
皮质
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
chn1 0.81 0.82
RGS4 0.78 0.85
TMEM155 0.76 0.69
KCNK1 0.75 0.77
anxa7 0.75 0.78
GCNT4 0.75 0.73
anxa11 0.75 0.82
SLC39A8 0.75 0.82
TPMT 0.74 0.73
主题 0.74 0.70
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SH3BP2 -0.67 -0.79
KIAA1949 -0.67 -0.67
PKN1 -0.67 -0.74
tubb2b -0.66 -0.74
CCDC123 -0.65 -0.66
ZNF311 -0.65 -0.66
pde9a -0.65 -0.75
marcksl1 -0.65 -0.67
Gmip -0.64 -0.61
ZNF300 -0.63 -0.61

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 7504174
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004428 肌醇或磷脂酰肌醇激酶活性 IEA -
GO:0016773 磷酸转移酶活性,酒精群作为受体 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0016303 1-磷脂酰肌醇-3-激酶活性 塔斯 7628435
GO:0030145 锰离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0048015 磷酸肌醇介导的信号传导 IEA -
GO:0046854 磷酸肌醇磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 14751759
去:0005942 磷酸肌醇3-激酶复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肌醇磷酸代谢 54 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
自噬调节 35 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
早期内体膜上PIPS的反应组合成 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在高尔基膜上的PIPS合成反应组合成 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在晚期内体膜上PIPS的反应组合成 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pi代谢 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K级联 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Grandvaux IRF3目标DN 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedvat Elf4靶向 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
整合素信号传导 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素耐药性DN处的sartipy正常 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GU PDEF目标 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞DN 76 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mizushima自噬体形成 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因