Gene Page:PIK3R2

概括?
GeneID 5296
Symbol PIK3R2
Synonyms MPPH|MPPH1|P85B|p85|p85-BETA
Description 磷酸肌醇-3-激酶调节亚基2
Reference MIM：603157|HGNC:HGNC:8980|Ensembl:ENSG00000105647|HPRD:04404|Vega:OTTHUMG00000183383
Gene type protein-coding
Map location 19q13.2-q13.4
Pascal p-value 0.601
Fetal beta 0.187
DMG 1（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
Meta

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
Network 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.3216

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) Beta (dis) FDR (dis) Study
cg27287167 19 18267904 PIK3R2 2.03E-4 -0.295 0.035 DMG:Wockner_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs4808137 chr19 18688846 PIK3R2 5296 0.19 cis

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
ITIH5 0.62 0.62
SEMA3G 0.59 0.54
COBLL1 0.58 0.54
LMO2 0.58 0.55
A2M 0.57 0.53
HSPA12B 0.57 0.57
ENPEP 0.57 0.50
GIMAP8 0.56 0.49
ENG 0.56 0.55
PGM5 0.55 0.51
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
RPL24 -0.30 -0.32
RPL35A -0.29 -0.32
GPR22 -0.29 -0.24
RPL23 -0.29 -0.32
NDUFAF2 -0.29 -0.31
TINP1 -0.29 -0.26
RPL5 -0.28 -0.25
FRG1 -0.28 -0.28
NEUROD6 -0.28 -0.17
RPL34 -0.28 -0.31

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 12029088
GO:0016303 1-磷脂酰肌醇-3-激酶活性 ISS -
GO:0035014 phosphoinositide 3-kinase regulator activity IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007165 signal transduction IEA -
GO:0019987 负调节抗凋亡 ISS -
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005829 cytosol EXP 12660731
GO:0005622 intracellular IEA -
去：0005942 磷酸肌醇3-激酶复合物 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
AXL JTK11 | UFO AXL receptor tyrosine kinase Axl interacts with p85-beta. BIND 12470648
AXL JTK11 | UFO AXL receptor tyrosine kinase - HPRD,BioGRID 9178760
CBL C-CBL | CBL2 | RNF55 Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence - HPRD,BioGRID 7629144
CCR2 CC-CKR-2 | CCR2A | CCR2B | CD192 | CKR2 | CKR2A | CKR2B | CMKBR2 | MCP-1-R chemokine (C-C motif) receptor 2 Affinity Capture-Western BioGRID 11350939
CCR5 CC-CKR-5 | CCCKR5 | CD195 | CKR-5 | CKR5 | CMKBR5 chemokine (C-C motif) receptor 5 Affinity Capture-Western BioGRID 11350939
CRKL - V-CRK肉瘤病毒CT10癌基因同源物（Avian）类似 - HPRD,BioGRID 9092574
CSF1 MCSF | MGC31930 colony stimulating factor 1 (macrophage) Biochemical Activity
Reconstituted Complex		 BioGRID 1334406
CSF1R C-FMS | CD115 | CSFR | FIM2 | FMS colony stimulating factor 1 receptor - HPRD 1334406
EGF homg4 |乌尔格 epidermal growth factor (beta-urogastrone) - HPRD,BioGRID 1334406
EGFR ERBB | ERBB1 | HER1 | PIG61 | mENA epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian) Tyrosine phosphorlyated EGFR interacts with p85-beta. BIND 11172806
ERBB2 CD340 | HER-2 | HER-2/neu | HER2 | NEU | NGL | TKR1 V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2，神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物（Avian） - HPRD,BioGRID 1334406
ERBB3 ErbB-3 | HER3 | LCCS2 | MDA-BF-1 | MGC88033 | c-erbB-3 | c-erbB3 | erbB3-S | p180-ErbB3 | p45-sErbB3 | p85-sErbB3 v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 3 (avian) 亲和力捕获ms BioGRID 16729043
ERBB4 HER4 | MGC138404 | p180erbB4 v-erb-a erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 4 (avian) 亲和力捕获ms BioGRID 16729043
FGFR1 BFGFR | CD331 | CEK | FGFBR | FLG | FLJ99988 | FLT2 | HBGFR | KAL2 | N-SAM fibroblast growth factor receptor 1 An unspecified isoform of FGFR1 interacts with p85-beta. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between FGFR1 from an unspecified species and human p85-beta. BIND 15117958
FYN MGC45350 | SLK | SYN FYN oncogene related to SRC, FGR, YES - HPRD,BioGRID 1334406
GRB2 ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 growth factor receptor-bound protein 2 - HPRD 8662998
IGF1R CD221 | IGFIR | JTK13 | MGC142170 | MGC142172 | MGC18216 insulin-like growth factor 1 receptor IGFIR interacts with p85. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between rat proteins. BIND 7541045
IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 IRS-1 interacts with p85-beta. This interaction was modeled based on a demonstrated interaction between IRS-1 from an unspecified species and p85-beta from an unknown species. BIND 11172806
IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 - HPRD 11120660
KIT C-Kit | CD117 | PBT | SCFR v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog Kit interacts with p85-beta. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between mouse proteins. BIND One hundred.22833
KIT C-Kit | CD117 | PBT | SCFR v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog 两个杂交 BioGRID One hundred.22833
KIT C-Kit | CD117 | PBT | SCFR v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog - HPRD 7537096
PDGFRB CD140B |JTK12 |PDGF-R-BETA |PDGFR |PDGFR1 platelet-derived growth factor receptor, beta polypeptide PDGFR与p85-alpha相互作用。这种相互作用是基于未知物种的人类PDGFR和p85-Alpha之间的相互作用进行建模的。 BIND 11172806
PIK3CD p110D phosphoinositide-3-kinase, catalytic, delta polypeptide - HPRD,BioGRID 9113989
SHC1 FLJ26504 | SHC | SHCA SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 - HPRD 8662998
SOCS1 CIS1 | CISH1 | JAB | SOCS-1 | SSI-1 | SSI1 | TIP3 抑制细胞因子的信号aling 1 Socs1 interacts with p85-beta. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between mouse Socs1 and p85-beta from an unspecified species. BIND One hundred.22833
tec MGC126760 | MGC126762 | PSCTK4 tec protein tyrosine kinase 两个杂交 BioGRID 9178903
TGFBR1 AAT5 | ACVRLK4 | ALK-5 | ALK5 | LDS1A | LDS2A | SKR4 | TGFR-1 transforming growth factor, beta receptor 1 - HPRD,BioGRID 9435577
TGFBR2 AAT3 | FAA3 | LDS1B | LDS2B | MFS2 | RIIC | TAAD2 | TGFR-2 | TGFbeta-RII 转化生长因子，β受体II（70/80KDA） Affinity Capture-Western BioGRID 9435577


V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG ERBB SIGNALING PATHWAY 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PHOSPHATIDYLINOSITOL SIGNALING SYSTEM 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MTOR SIGNALING PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG APOPTOSIS 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG VEGF SIGNALING PATHWAY 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TOLL LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG JAK STAT SIGNALING PATHWAY 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NATURAL KILLER CELL MEDIATED CYTOTOXICITY 137 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG T CELL RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG B CELL RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 75 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FC EPSILON RI SIGNALING PATHWAY 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FC GAMMA R MEDIATED PHAGOCYTOSIS 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LEUKOCYTE TRANSENDOTHELIAL MIGRATION 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NEUROTROPHIN SIGNALING PATHWAY 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG INSULIN SIGNALING PATHWAY 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PROGESTERONE MEDIATED OOCYTE MATURATION 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TYPE II DIABETES MELLITUS 47 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ALDOSTERONE REGULATED SODIUM REABSORPTION 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG COLORECTAL CANCER 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG RENAL CELL CARCINOMA 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胰腺癌 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG子宫内膜癌 52 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GLIOMA 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PROSTATE CANCER 89 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MELANOMA 71 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHRONIC MYELOID LEUKEMIA 73 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ACUTE MYELOID LEUKEMIA 60 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG SMALL CELL LUNG CANCER 84 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NON SMALL CELL LUNG CANCER 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB4 PATHWAY 38 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRAIL PATHWAY 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCPTP途径 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAS PATHWAY 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1 RECEPTOR PROXIMAL PATHWAY 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3KCI PATHWAY 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1 DOWNSTREAM PATHWAY 105 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB2 ERBB3 PATHWAY 44 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB PATHWAY 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NEPHRIN NEPH1 PATHWAY 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1 INTERNALIZATION PATHWAY 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR3 PATHWAY 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY RHO GTPASES 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALLING BY NGF 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY SCF KIT 78 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CELL COMMUNICATION 120 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IL 7 SIGNALING 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INSULIN RECEPTOR SIGNALLING CASCADE 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NGF SIGNALLING VIA TRKA FROM THE PLASMA MEMBRANE 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PHOSPHOLIPID METABOLISM 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SYNTHESIS OF PIPS AT THE PLASMA MEMBRANE 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI METABOLISM 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI3K AKT ACTIVATION 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TCR SIGNALING 54 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM TCR SIGNALING 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TIE2 SIGNALING 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY GPCR 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY PDGF 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNAL TRANSDUCTION 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Q SIGNALLING EVENTS 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA1213 SIGNALLING EVENTS 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CD28 CO STIMULATION 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPCR DOWNSTREAM SIGNALING 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME COSTIMULATION BY THE CD28 FAMILY 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CD28 DEPENDENT PI3K AKT SIGNALING 22 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF SIGNALING BY CBL 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEPHRIN INTERACTIONS 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IL 3 5 AND GM CSF SIGNALING 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IL RECEPTOR SHC SIGNALING 27 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IL 2 SIGNALING 41 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY INSULIN RECEPTOR 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI3K CASCADE 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂黄色DN的反应 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION DN 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER GRADES 1 2 UP 137 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUMMERICH SKIN CANCER PROGRESSION DN One hundred. 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DING LUNG CANCER MUTATED FREQUENTLY 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUTT GBM VS AO GLIOMA UP 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN VARIABLE EARLY DIFFERENTIATION GENES UP 15 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS CONFLUENT 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RARG BOUND MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER KDM1A TARGETS DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-135 425 432 1A,m8 hsa-miR-135a UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA
hsa-miR-135b UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
miR-30-5p 371 378 1A,m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30cbrain uguaaacauccuacucucucucucagc
hsa-miR-30dSZ uguaaacauccccgacuggaag
hsa-miR-30bSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p uguaaacauccuugacugga