基因页:pitpna
概括?
基因 | 5306 |
象征 | pitpna |
同义词 | HEL-S-36 | PI-TPALPHA | PITPN | VIB1A |
描述 | 磷脂酰肌醇转移蛋白α |
参考 | MIM:600174|HGNC:HGNC:9001|ENSEMBL:ENSG00000174238|HPRD:02548|Vega:Otthumg00000177779 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.3 |
Pascal P值 | 0.025 |
Sherlock P值 | 0.424 |
胎儿β | -0.606 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 |
支持 | 细胞代谢 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG09486967 | 17 | 1437322 | pitpna | 1.58e-5 | 0.515 | 0.015 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PITPNA_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Arhgef1 | 0.76 | 0.78 |
BMP1 | 0.76 | 0.74 |
LTBP3 | 0.75 | 0.75 |
SLC27A1 | 0.75 | 0.80 |
PLCB3 | 0.75 | 0.78 |
PLXNB1 | 0.73 | 0.75 |
HDAC1 | 0.73 | 0.76 |
clcn2 | 0.73 | 0.77 |
mov10 | 0.73 | 0.71 |
AL161668.2 | 0.72 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TMEM70 | -0.45 | -0.49 |
CALM2 | -0.44 | -0.46 |
PPP3CB | -0.43 | -0.44 |
C20ORF7 | -0.40 | -0.50 |
NDUFAF4 | -0.40 | -0.43 |
FGF12 | -0.40 | -0.37 |
TCEAL7 | -0.40 | -0.42 |
BRP44 | -0.40 | -0.46 |
DPP10 | -0.40 | -0.38 |
EFHA2 | -0.40 | -0.40 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID Netrin途径 | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第二使者在netrin1信号传导中的作用 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘鼻咽癌 | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Takao对UVB辐射DN的响应 | 98 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN | 68 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine乳头状甲状腺癌 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |