概括
基因 5306
象征 pitpna
同义词 HEL-S-36 | PI-TPALPHA | PITPN | VIB1A
描述 磷脂酰肌醇转移蛋白α
参考 MIM:600174|HGNC:HGNC:9001|ENSEMBL:ENSG00000174238|HPRD:02548|Vega:Otthumg00000177779
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.3
Pascal P值 0.025
Sherlock P值 0.424
胎儿β -0.606
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
支持 细胞代谢
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG09486967 17 1437322 pitpna 1.58e-5 0.515 0.015 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Arhgef1 0.76 0.78
BMP1 0.76 0.74
LTBP3 0.75 0.75
SLC27A1 0.75 0.80
PLCB3 0.75 0.78
PLXNB1 0.73 0.75
HDAC1 0.73 0.76
clcn2 0.73 0.77
mov10 0.73 0.71
AL161668.2 0.72 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TMEM70 -0.45 -0.49
CALM2 -0.44 -0.46
PPP3CB -0.43 -0.44
C20ORF7 -0.40 -0.50
NDUFAF4 -0.40 -0.43
FGF12 -0.40 -0.37
TCEAL7 -0.40 -0.42
BRP44 -0.40 -0.46
DPP10 -0.40 -0.38
EFHA2 -0.40 -0.40

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID Netrin途径 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
第二使者在netrin1信号传导中的作用 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Netrin1信号传导 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘鼻咽癌 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takao对UVB辐射DN的响应 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN 68 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因