基因页：PITX2

概括？
基因 5308
象征 PITX2
同义词 arp1 | brx1 | idg2 | igds | igds2 | ihg2 | irid2 | otlx2 | ptx2 | rgs | rieg | rieg1 | rs | rs
描述 像同源域2配对
参考 MIM：601542|HGNC：HGNC：9005|ENSEMBL：ENSG00000164093|HPRD：03328|Vega：Otthumg00000132837
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q25
Pascal P值 0.17
胎儿β -0.209
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7670908 CHR4 110892624 PITX2 5308 0.06 顺式
RS9991367 CHR4 110894300 PITX2 5308 0.06 顺式
RS11569104 CHR4 110924641 PITX2 5308 0.08 顺式
RS3733626 CHR4 110925491 PITX2 5308 0.1 顺式
RS11569126 CHR4 110929652 PITX2 5308 0.11 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC26A8 0.49 0.48
CYP2E1 0.49 0.43
Arpp-21 0.47 0.47
LRRC37A3 0.46 0.51
SNX32 0.45 0.43
FER1L4 0.45 0.29
SAMD3 0.45 0.46
CC2D1A 0.44 0.49
最好的4 0.44 0.46
L3MBTL 0.44 0.50
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC021016.1 -0.31 -0.36
COPZ2 -0.30 -0.33
MT-CO2 -0.29 -0.31
AF347015.21 -0.29 -0.35
AF347015.33 -0.29 -0.30
AF347015.31 -0.29 -0.31
S100B -0.28 -0.29
AIF1L -0.28 -0.32
higd1b -0.28 -0.31
mt-cyb -0.28 -0.30

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Pitx2途径 15 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
st g alpha i路径 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG趋化性 45 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wnt信令 89 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
圣肾上腺素能 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St GAQ途径 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Myocyte广告路径 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Beta Catenin nuc途径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌6小时DN 167 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化HBZ 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化hemgn 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Mycn扩增靶向 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 128 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhattacharya胚胎干细胞 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Rorie目标 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Visala对热冲击和衰老的反应 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌DN中甲基化的甲基化 28 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schraets MLL靶向DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McMurray TP53 HRAS合作响应DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏开发 166 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因