基因页面:PLCB4
总结吗?
| GeneID | 5332年 |
| 象征 | PLCB4 |
| 同义词 | ARCND2 | PI-PLC |
| 描述 | 磷脂酶Cβ4 |
| 参考 | MIM: 600810|HGNC: HGNC: 9059|运用:ENSG00000101333|HPRD: 02885|织女:OTTHUMG00000031853 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 20 p12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.794 |
| 夏洛克假定值 | 0.292 |
| 胎儿β | -0.224 |
| eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | CANABINOID 细胞内信号转导 METABOTROPIC谷氨酸受体 5 -羟色胺 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.046 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6055624 | chr20 | 8171571 | PLCB4 | 5332年 | 0.15 | 独联体 | ||
| rs16994533 | chr20 | 8218964 | PLCB4 | 5332年 | 0.11 | 独联体 | ||
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | PLCB4 | 5332年 | 2.81 e-8 | 反式 | ||
| rs3845734 | chr2 | 171125572 | PLCB4 | 5332年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs7584986 | chr2 | 184111432 | PLCB4 | 5332年 | 1.961的军医 | 反式 | ||
| rs2183142 | chr4 | 159232695 | PLCB4 | 5332年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs3111196 | chr5 | 54402889 | PLCB4 | 5332年 | 0.15 | 反式 | ||
| rs17762315 | chr5 | 76807576 | PLCB4 | 5332年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs9461864 | chr6 | 33481468 | PLCB4 | 5332年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs2393316 | chr10 | 59333070 | PLCB4 | 5332年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | PLCB4 | 5332年 | 3.598 e-13 | 反式 | ||
| rs1940436 | chr18 | 415400年 | PLCB4 | 5332年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs1041786 | chr21 | 22617710 | PLCB4 | 5332年 | 0 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AL161668.2 | 0.82 | 0.84 |
| KIAA0195 | 0.81 | 0.80 |
| ARAP1 | 0.81 | 0.81 |
| LTBP3 | 0.80 | 0.80 |
| SLC27A1 | 0.80 | 0.84 |
| ASAP3 | 0.78 | 0.78 |
| GPR56 | 0.78 | 0.82 |
| CASKIN2 | 0.77 | 0.77 |
| GPT2 | 0.77 | 0.75 |
| DNM2 | 0.77 | 0.76 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PPEF1 | -0.49 | -0.49 |
| THOC7 | -0.48 | -0.52 |
| CALM2 | -0.48 | -0.50 |
| BRP44 | -0.48 | -0.55 |
| GLMN | -0.47 | -0.54 |
| GPR160 | -0.47 | -0.55 |
| TCEAL7 | -0.47 | -0.51 |
| TMEM70 | -0.46 | -0.53 |
| USMG5 | -0.45 | -0.59 |
| BEX5 | -0.45 | -0.47 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004871 | 信号传感器活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 16767099 | |
| 去:0004435 | 磷酸肌醇磷脂酶C活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016787 | 水解酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016042 | 脂质分解过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007242 | 细胞内的信号级联 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006629 | 脂质代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0014069 | 突触后密度 | 国际能源机构 | Synap(词级:10) | - - - - - - |
| 去:0030425 | 树突 | 国际能源机构 | 神经元,轴突、树突(术语层面:6) | - - - - - - |
| 去:0005792 | 微粒体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005790 | 光滑型内质网 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG磷酸肌醇代谢 | 54 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG钙信号通路 | 178年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG趋化因子信号通路 | 190年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG磷脂酰肌醇信号系统 | 76年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG血管平滑肌收缩 | 115年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG WNT信号通路 | 151年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG缝隙连接 | 90年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG长期势差现象 | 70年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG长期萧条 | 70年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG促性腺激素信号通路 | 101年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG杀菌作用 | 102年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG老年痴呆症病 | 169年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG亨廷顿疾病 | 185年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 圣Gα我途径 | 35 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME胃泌激素分子通过PKC和MAPK信号通路 | 205年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME阿片类信号 | 78年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME PLCβ介导的事件 | 43 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GαQ信号事件 | 184年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI PAX FOXO1融合DN的目标 | 68年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BASAKI YBX1目标了 | 290年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1突变签名1 DN | 126年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1签名3 DN | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JAATINEN造血干细胞 | 316年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ODONNELL转移了 | 82年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| streich LSM1目标了 | 44 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3 XPCS DN | 88年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌复发率高 | 49 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道森在淋巴瘤TCL1甲基化 | 59 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化好与差 | 236年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化好VS适度 | 109年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移了 | 344年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼头颈癌 | One hundred. | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROZANOV MMP14目标了 | 266年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 哈达德T淋巴细胞及NK祖 | 78年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AFFAR YY1目标了 | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王SMARCE1 DN的目标 | 371年 | 218年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过NOVA2 ULE拼接 | 43 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒6小时DN | 160年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 到湖底三苯氧胺耐药性DN | 220年 | 147年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌H3K27ME3 DN | 228年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌和直肠癌 | 285年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄达沙替尼耐DN | 69年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FIRESTEIN扩散 | 175年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SASAI CXCR6和PTCH1的目标 | 13 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYLAN多发性骨髓瘤C D DN | 252年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 顾PDEF目标了 | 71年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARIADASON应对丁酸姜黄素苏灵大TSA 1 | 10 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 尼尔森要点 | 98年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒1小时DN | 222年 | 147年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK胶质母细胞瘤颈板 | 177年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WIERENGA PML INTERACTOME | 42 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TORCHIA EWSR1 FLI1融合DN的目标 | 321年 | 200年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IKEDA MIR30目标了 | 116年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SERVITJA胰岛HNF1A目标 | 163年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型 | 182年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO DN FGFR1在前列腺癌的目标模型 | 308年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| let-7/98 | 493年 | 499年 | 1 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
| hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
| hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
| hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
| hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
| hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
| hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
| hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
| hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
| miR-130/301 | 399年 | 405年 | 1 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
| hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
| hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
| mir - 183 | 507年 | 513年 | m8 | hsa - mir - 183 | UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG |
| mir - 190 | 1122年 | 1128年 | 1 | hsa - mir - 190 | UGAUAUGUUUGAUAUAUUAGGU |
| mir - 214 | 1200年 | 1206年 | m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| miR-23 | 752年 | 758年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-30-5p | 651年 | 657年 | 1 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir - 323 | 752年 | 758年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 365 | 1031年 | 1037年 | m8 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
| mir - 378 | 1126年 | 1132年 | 1 | hsa - mir - 378 | CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU |
| mir - 381 | 1348年 | 1354年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| mir - 96 | 597年 | 604年 | 1、m8 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |