基因页面:PLCD1

总结吗?
GeneID 5333年
象征 PLCD1
同义词 NDNC3 | PLC-III
描述 磷脂酶Cδ1
参考 MIM: 602142|HGNC: HGNC: 9060|运用:ENSG00000187091|HPRD: 09073|织女:OTTHUMG00000130813
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3 p22-p21.3
帕斯卡假定值 0.389
夏洛克假定值 0.187
胎儿β -0.683
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.006

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg23971255 3 38071301 PLCD1 1.85的军医 -0.262 0.034 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs11080561 chr18 12257229 PLCD1 5333年 0.01 反式
rs10126993 chrX 35885796 PLCD1 5333年 0 反式
rs6527524 0 PLCD1 5333年 0 反式
rs4501739 chrX 35960848 PLCD1 5333年 8.183 e-5 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
PCTK3 0.94 0.92
ATPGD1 0.93 0.92
SHROOM1 0.92 0.93
SEMA3B 0.92 0.89
TMEM63A 0.91 0.94
ABCA2 0.90 0.74
TMC6 0.90 0.89
UAP1L1 0.90 0.93
C11orf9 0.90 0.91
CD22 0.90 0.91
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
POLB -0.55 -0.79
MED19 -0.54 -0.74
FRG1 -0.53 -0.75
STMN1 -0.53 -0.73
ALKBH2 -0.52 -0.76
IFT52 -0.52 -0.74
TRNAU1AP -0.52 -0.72
NR2C2AP -0.52 -0.75
ING4 -0.51 -0.72
RARS2 -0.51 -0.70

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0004871 信号传感器活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005509 钙离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0004435 磷酸肌醇磷脂酶C活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0004435 磷酸肌醇磷脂酶C活动 助教 9588182
去:0016787 水解酶活性 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0001525 血管生成 国际能源机构 - - - - - -
去:0001890 胎盘发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0016042 脂质分解过程 国际能源机构 - - - - - -
去:0007242 细胞内的信号级联 国际能源机构 - - - - - -
去:0006644 磷脂代谢过程 助教 9588182
去:0006629 脂质代谢过程 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005829 胞质 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 艾达 15702972

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG磷酸肌醇代谢 54 42 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG钙信号通路 178年 134年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG磷脂酰肌醇信号系统 76年 56 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标12小时 162年 116年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应表皮 293年 179年 所有SZGR 2.0基因通路
DELYS甲状腺癌了 443年 294年 所有SZGR 2.0基因通路
BERENJENO改变了RHOA DN 394年 258年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP63目标 355年 243年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP53和TP63目标 205年 145年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展48小时 487年 286年 所有SZGR 2.0基因通路
GOLDRATH免疫记忆 65年 42 所有SZGR 2.0基因通路
一致的脂肪细胞的分化了 74年 51 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染14小时血巨细胞病毒DN 298年 200年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染48小时血巨细胞病毒DN 504年 323年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒18 hr DN 178年 121年 所有SZGR 2.0基因通路
江缺氧正常 311年 205年 所有SZGR 2.0基因通路
对紫外线C7 SESTO回应 68年 44 所有SZGR 2.0基因通路
马森受FOXP3刺激 1022年 619年 所有SZGR 2.0基因通路
王肿瘤侵袭性了 374年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
60张及目标的人力资源 293年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
张及目标了 108年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP 536年 296年 所有SZGR 2.0基因通路
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 682年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
促进DN KDM1A目标 211年 119年 所有SZGR 2.0基因通路
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 1839年 928年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 191 193年 200年 1、m8 hsa - mir - 191大脑 CAACGGAAUCCCAAAAGCAGCU