SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

基因	53615
象征	MBD3
同义词	-
描述	甲基-CPG结合结构域蛋白3
参考	MIM：603573\|HGNC：HGNC：6918\|Ensembl：ENSG0000000071655\|HPRD：04653\|Vega：Otthumg00000180081
基因类型	蛋白质编码
地图位置	19p13.3
Pascal P值	0.089
Sherlock P值	0.363
胎儿β	-0.133
主持人	迈尔斯的顺式和跨性别
支持	Ascano FMRP目标染色质重塑基因

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	高通量文献搜索	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS4491879	CHR3	189373908	MBD3	53615		0.16		反式
RS17542473	CHR4	111182451	MBD3	53615		0.2		反式
RS2143256	CHR20	9664538	MBD3	53615		0.09		反式
RS6039548	CHR20	9666092	MBD3	53615		0.14		反式
RS6056802		0	MBD3	53615		0.09		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
奥卡	aik \|ark1 \|光环\|Aurora2 \|btak \|MGC34538 \|STK15 \|stk6 \|STK7	Aurora激酶A。	-	HPRD，Biogrid	12354758
Bcl6	bcl5 \|bcl6a \|laz3 \|ZBTB27 \|Znf51	B细胞CLL/淋巴瘤6	Bcl6与MBD3相互作用。	绑定	15454082
CHD4	DKFZP686E06161 \|Mi-2b \|mi2-beta	染色体瘤酶DNA结合蛋白4	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12354758
DNMT1	目标\|CXXC9 \|DNMT \|FLJ16293 \|MCMT \|MGC104992	DNA（胞嘧啶-5-） - 甲基转移酶1	-	HPRD	10947852
gatad2a	FLJ20085 \|FLJ21017 \|p66alpha	含有2A的GATA锌指域	-	HPRD，Biogrid	12183469
gatad2b	FLJ37346 \|KIAA1150 \|MGC138257 \|MGC138285 \|p66beta \|RP11-216N14.6	含有2B的GATA锌指域	-	HPRD	12183469
gatad2b	FLJ37346 \|KIAA1150 \|MGC138257 \|MGC138285 \|p66beta \|RP11-216N14.6	含有2B的GATA锌指域	-	HPRD，Biogrid	11756549\|12183469
HDAC1	DKFZP686H12203 \|gon-10 \|HD1 \|RPD3 \|RPD3L1	组蛋白脱乙酰基酶1	-	HPRD，Biogrid	12124384
HDAC1	DKFZP686H12203 \|gon-10 \|HD1 \|RPD3 \|RPD3L1	组蛋白脱乙酰基酶1	MBD3与HDAC1相互作用。	绑定	12124384
HDAC2	RPD3 \|yaf1	组蛋白脱乙酰基酶2	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12354758
MBD2	DKFZP586O0821 \|DMTase \|NY-CO-41	甲基-CPG结合结构域蛋白2	-	HPRD	10947852
MBD2	DKFZP586O0821 \|DMTase \|NY-CO-41	甲基-CPG结合结构域蛋白2	重构的复合物两个杂交	Biogrid	10444591\|15456747
MBD3	-	甲基-CPG结合结构域蛋白3	两个杂交	Biogrid	15456747
MBD3L1	MBD3L \|MGC138263 \|MGC138269	甲基-CPG结合结构域蛋白3样1	-	HPRD，Biogrid	15456747
MTA2	DKFZP686F2281 \|mta1l1 \|pid	转移相关的1个家庭，成员2	MBD3与MTA2相互作用。	绑定	12124384
MTA2	DKFZP686F2281 \|mta1l1 \|pid	转移相关的1个家庭，成员2	-	HPRD，Biogrid	12124384
RBBP4	NURF55 \|RBAP48	视网膜母细胞瘤结合蛋白4	-	HPRD，Biogrid	10444591
RBBP7	MGC138867 \|MGC138868 \|RBAP46	视网膜母细胞瘤结合蛋白7	-	HPRD，Biogrid	10444591
spen	KIAA0929 \|薄荷\|RP1-134O19.1 \|锋利的	SPEN同源物，转录调节剂（果蝇）	-	HPRD	11331609

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
Biocarta MTA3途径	19	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC Classi途径	66	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN	335	193	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应	770	415	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲	479	299	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因	230	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Voxphos	87	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans	882	572	该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病	157	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC	210	123	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D DN	64	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN	274	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002	429	260	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体	447	277	该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN	841	431	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES	462	273	该途径中的所有SZGR 2.0基因