基因页:prkag3
概括?
基因 | 53632 |
象征 | prkag3 |
同义词 | AMPKG3 |
描述 | 蛋白激酶AMP激活的非催化亚基3 |
参考 | MIM:604976|HGNC:HGNC:9387|Ensembl:ENSG00000115592|HPRD:16085|Vega:Otthumg00000133078 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q35 |
Pascal P值 | 0.987 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01016 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00916 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
prkag3 | CHR2 | 219696473 | G | 一个 | NM_017431 | 。 | 沉默的 | 精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16869851 | CHR4 | 20690056 | prkag3 | 53632 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRKAG3_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004679 | AMP激活的蛋白激酶活性 | 塔斯 | 10698692 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007243 | 蛋白激酶级联反应 | 塔斯 | 10698692 | |
去:0006633 | 脂肪酸生物合成过程 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG脂肪细胞信号传导途径 | 67 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG肥厚性心肌病HCM | 85 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Chrebp2途径 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔瘦素途径 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过LKB1对AMPK活性的反应组调节 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lkb1 ampk对MTOR的反应组能量依赖性调节 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMPK对RHEB GTPase活性的反应组调节 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PKB介导的事件 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai慢性肝炎与肝癌DN | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kuninger IGF1与PDGFB的目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |