基因页：PMP22

概括?
GeneID 5376
Symbol PMP22
同义词 CMT1A|CMT1E|DSS|GAS-3|GAS3|HMSNIA|HNPP|Sp110
描述 peripheral myelin protein 22
参考 MIM：601097|HGNC:HGNC:9118|Ensembl：ENSG00000109099|HPRD:03059|Vega:OTTHUMG00000058960
Gene type protein-coding
地图位置 17p12
Pascal P值 0.394
度p-value DEG：Zhao_2015:p=4.23e-04:q=0.0926
Fetal beta -1.853

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG：Zhao_2015 RNA测序分析 Transcriptome sequencing and genome-wide association analyses reveal lysosomal function and actin cytoskeleton remodeling in schizophrenia and bipolar disorder.
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 2

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO：0032288 myelin formation IEA Axon（GO术语级别：14） -
GO:0007268 突触传输 塔斯 neuron, Synap, Neurotransmitter (GO term level: 6) 8275092
GO:0007605 sensory perception of sound IEA -
GO:0007422 peripheral nervous system development 塔斯 8275092
GO:0007638 mechanosensory行为 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0016021 integral to membrane IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
PID A6B1 A6B4强度GRIN PATHWAY 46 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC LYMPHOMA UP 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
grabarczyk bcl11b目标 81 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS UP 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LMO4 TARGETS DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION SUSTAINED IN GRANULOCYTE DN 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION GRANULOCYTE DN 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE NEURAL CREST STEM CELL UP 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML DIVIDING VS NORMAL QUIESCENT UP 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER UP 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LASTOWSKA NEUROBLASTOMA COPY NUMBER UP 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YORDY RECIPROCAL REGULATION BY ETS1 AND SP100 DN 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAZAG TGFB1 SIGNALING UP 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN 51 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tomlins前列腺癌DN 40 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLESINGER METHYLATED DE NOVO IN CANCER 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 AND HIF1A DN 103 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标UP 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH PRC2 TARGETS 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 UP 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2 TARGETS DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI HOXC8 TARGETS UP 12 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ASTON MAJOR DEPRESSIVE DISORDER DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jechlinger上皮到间充质转变 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANNAN TP53 TARGETS DN 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG IMMORTALIZED BY TERT DN 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radmacher AML预后 78 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGLESIAS E2F TARGETS UP 151 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kaab失败的心房DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING MUSCLE DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D7 40 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN 106 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时DN 101 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS UP 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HILLION HMGA1 TARGETS 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN PONS MARKERS 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN MEDULLA MARKERS 81 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE UP 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 8G 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS PTEN DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENGELMANN CANCER PROGENITORS UP 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移模型DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移神经 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS UP 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAN SATB1 TARGETS DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOO LIVER CANCER RECURRENCE UP 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHOEN NFKB SIGNALING 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD RESPONSE TO TZD DN 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS DURATION CORR DN 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IKEDA MIR1 TARGETS UP 53 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA ISLET HNF1A TARGETS UP 163 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-139 1011 1018 1A,m8 hsa-miR-139脑 UCUACAGUGCACGUGUCU
mir-145 728 734 1A hsa-miR-145 GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU
mir-199 727 733 1A hsa-miR-199a cccaguucagacuaccuguuc
hsa-miR-199b CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC
mir-29 677 684 1A,m8 hsa-miR-29aSZ uagcaccaucugaaaucgguu
hsa-miR-29bSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
hsa-miR-29cSZ UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir-381 995 1001 m8 hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-493-5p 210 216 m8 hsa-miR-493-5p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
miR-505 253 259 m8 HSA-MIR-505 GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC
miR-9 435 441 m8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga