概括
基因 5378
象征 PMS1
同义词 HNPCC3 | MLH2 | PMSL1 | HPMS1
描述 PMS1同源物1,不匹配维修系统组件
参考 MIM:600258|HGNC:HGNC:9121|Ensembl:ENSG0000000064933|HPRD:02597|Vega:Otthumg00000132664
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q31.1
Pascal P值 0.279
Sherlock P值 0.263
胎儿β 0.786
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10081115 2 190686883 PMS1 5.854e-4 0.339 0.05 DMG:Wockner_2014
CG26708280 2 190649305 PMS1 3.05e-9 -0.026 2.09E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11224047 Chr11 134737682 PMS1 5378 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wakasugi有Znf143绑定位点 58 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
myllykangas放大热点25 15 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEART HDAC增殖集群DN 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML生存 129 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su睾丸 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 2小时DN的响应 55 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因