基因页:FXYD6
概括?
基因 | 53826 |
象征 | FXYD6 |
同义词 | - |
描述 | FXYD域含有离子传输调节器6 |
参考 | MIM:606683|HGNC:HGNC:4030|ENSEMBL:ENSG00000137726|HPRD:09456|Vega:Otthumg00000166991 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q23.3 |
Pascal P值 | 0.501 |
Sherlock P值 | 0.589 |
胎儿β | -0.179 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23793599 | 11 | 117749424 | FXYD6 | 2.652E-4 | 0.503 | 0.038 | DMG:Wockner_2014 |
CG03821689 | 11 | 117748187 | FXYD6 | 5.735E-4 | 0.568 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
CG05327447 | 11 | 117747417 | FXYD6 | 5.932E-4 | -0.285 | 0.05 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FXYD6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008150 | 生物_Process | nd | - | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005615 | 细胞外空间 | ISS | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | ISS | - | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 11256614 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
加兹达钻石黑凡富贫血祖细胞 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发12小时DN | 57 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee衰老的新皮层 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 DN | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-137 | 816 | 822 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |