概括
基因 53826
象征 FXYD6
同义词 -
描述 FXYD域含有离子传输调节器6
参考 MIM:606683|HGNC:HGNC:4030|ENSEMBL:ENSG00000137726|HPRD:09456|Vega:Otthumg00000166991
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.3
Pascal P值 0.501
Sherlock P值 0.589
胎儿β -0.179
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23793599 11 117749424 FXYD6 2.652E-4 0.503 0.038 DMG:Wockner_2014
CG03821689 11 117748187 FXYD6 5.735E-4 0.568 0.049 DMG:Wockner_2014
CG05327447 11 117747417 FXYD6 5.932E-4 -0.285 0.05 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003674 Molecular_Function nd -
去:0005216 离子通道活动 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008150 生物_Process nd -
去:0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005615 细胞外空间 ISS -
GO:0016021 膜不可或缺 ISS -
去:0005886 质膜 艾达 11256614

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
加兹达钻石黑凡富贫血祖细胞 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时DN 57 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的新皮层 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-137 816 822 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag