基因页:SLCO1C1
概括?
基因 | 53919 |
象征 | SLCO1C1 |
同义词 | OATP-F | OATP1 | OATP14 | OATP1C1 | OATPF | OATPRP5 | SLC21A14 |
描述 | 溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1C1 |
参考 | MIM:613389|HGNC:HGNC:13819|Ensembl:ENSG00000139155|HPRD:08342|Vega:Otthumg00000168966 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12p12.2 |
Pascal P值 | 0.021 |
胎儿β | -1.212 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10770705 | 12 | 20857467 | 无效的 | 1.509 | SLCO1C1 | 无效的 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLCO1C1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
维生素核苷和相关分子的反应组转运 | 31 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
有机阴离子的反应组传输 | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lein脉络丛标记 | 103 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |