概括
基因 53919
象征 SLCO1C1
同义词 OATP-F | OATP1 | OATP14 | OATP1C1 | OATPF | OATPRP5 | SLC21A14
描述 溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1C1
参考 MIM:613389|HGNC:HGNC:13819|Ensembl:ENSG00000139155|HPRD:08342|Vega:Otthumg00000168966
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p12.2
Pascal P值 0.021
胎儿β -1.212

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS10770705 12 20857467 无效的 1.509 SLCO1C1 无效的


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维生素核苷和相关分子的反应组转运 31 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有机阴离子的反应组传输 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lein脉络丛标记 103 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因