概括
基因 53981
象征 CPSF2
同义词 CPSF100
描述 裂解和聚腺苷酸化因子2
参考 MIM:606028|HGNC:HGNC:2325|HPRD:05824|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q31.1
Pascal P值 0.3
Sherlock P值 0.769
胎儿β 0.252
主持人 尾状基底神经节
小脑
皮质
海马
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 0
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG05007375 14 92588364 NDUFB1; CPSF2 7.8e-5 -0.215 0.025 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组的内在mRNA的处理 14 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成熟转录本向细胞质的反应组传输 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol II转录 105 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA剪接 111 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
封顶的无固定前mRNA的反应组件处理 23 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA 3末端处理 35 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组在终止区域增长的转录本的裂解 44 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Inamura肺癌SCC子类型 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 128 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chesler Brain QTL顺式 75 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim生发中心T助手 66 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL顺式 65 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
切斯勒大脑最高遗传差异 37 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因