基因页：9月4日
概括？
| 基因 | 5414 |
| 象征 | 9月4日 |
| 同义词 | 艺术| Bradeion | CE5B3 | H5 | MART | PNUTL2 | SEP4 | HCDCREL-2 | HUCEP-7 |
| 描述 | 9月4日 |
| 参考 | MIM：603696|HGNC：HGNC：9165|ENSEMBL：ENSG00000108387|HPRD：04738|Vega：Otthumg00000179243 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17Q22 |
| Pascal P值 | 6.625E-4 |
| Sherlock P值 | 0.522 |
| 耶和华 | 梭子基底神经节 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMANPSD G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID：COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS34704261 | 17 | 56353429 | 9月4日 | ENSG00000108387.10 | 1.54396E-6 | 0.02 | 264750 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS117369354 | 17 | 56371332 | 9月4日 | ENSG00000108387.10 | 3.39794E-6 | 0.02 | 246847 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS75751534 | 17 | 56377870 | 9月4日 | ENSG00000108387.10 | 3.73691E-6 | 0.02 | 240309 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共同表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| rarres3 | 0.80 | 0.79 |
| SDS | 0.79 | 0.73 |
| MGST1 | 0.79 | 0.78 |
| agxt2l1 | 0.79 | 0.75 |
| mt1x | 0.78 | 0.75 |
| IL17RB | 0.78 | 0.62 |
| NQO1 | 0.78 | 0.78 |
| SCRG1 | 0.75 | 0.77 |
| SAT1 | 0.75 | 0.73 |
| TAPBPL | 0.75 | 0.73 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MKL1 | -0.51 | -0.69 |
| SPTAN1 | -0.51 | -0.72 |
| ube2o | -0.51 | -0.65 |
| GTF2F1 | -0.51 | -0.72 |
| myo18a | -0.51 | -0.63 |
| USP7 | -0.51 | -0.68 |
| kif3c | -0.51 | -0.72 |
| HERC1 | -0.51 | -0.69 |
| rusc2 | -0.51 | -0.69 |
| Neurl4 | -0.50 | -0.72 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003924 | GTPase活性 | tas | 9889007 | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | tas | 9889007 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
| 去：0000910 | 细胞因子 | tas | 9889007 | |
| 去：0007049 | 细胞周期 | IEA | - | |
| 去：0042981 | 调节凋亡 | nas | 11146656 | |
| 细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | nas | 11146656 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005739 | 线粒体 | nas | 11146656 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 家长MTOR信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 | 38 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 萨那对ifng的回应 | 78 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的大脑 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江式下丘脑老化 | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein星形胶质细胞标记 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein少突胶质细胞标记 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化沉默的目标 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西部肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SEKI炎症反应LPS DN | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕激素簇的时间反应11 | 103 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A目标 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-214 | 115 | 122 | 1A，M8 | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |