Summary
基因ID 5420
象征 podxl
同义词 GP200 | PC | PCLP | PCLP-1
描述 足形蛋白喜欢
参考 MIM:602632|HGNC:HGNC:9171|HPRD:04025|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q32-Q33
Pascal P值 0.795
Sherlock P值 0.956
胎儿β 0.18
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS7801375 CHR7 131567263 Ag 2.261E-8 基因间 PODXL,LOC101928782 dist = 325887; dist = 27716

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16891338 CHR8 119671196 podxl 5420 0.11 反式
RS17180382 Chr11 44656785 podxl 5420 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
POU2F1 0.81 0.76
AC022098.3 0.79 0.74
FBXL19 0.74 0.79
ZFHX2 0.74 0.75
HIC2 0.73 0.86
GPRIN2 0.72 0.71
C22ORF23 0.71 0.78
fut7 0.71 0.53
AC010536.2 0.70 0.79
Arid3a 0.69 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ABCG2 -0.48 -0.63
HLA-F -0.48 -0.64
aldoc -0.47 -0.65
COPZ2 -0.46 -0.71
ITM2B -0.46 -0.59
FBXO2 -0.46 -0.61
TSC22D4 -0.46 -0.68
C5orf53 -0.46 -0.67
HLA-C -0.45 -0.59
FAM162A -0.45 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向 94 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纽曼ERCC6靶向DN 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 DN 67 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和TP63的Schavolt目标 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU细胞迁移 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 83 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhattacharya胚胎干细胞 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kaab失败的心房DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线低剂量DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦人响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标3 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因