基因页：trem2
概括？
| 基因 | 54209 |
| 象征 | trem2 |
| 同义词 | trem-2 | trem2a | trem2b | trem2c |
| 描述 | 触发在髓样细胞2上表达的受体2 |
| 参考 | MIM：605086|HGNC：HGNC：17761|Ensembl：ENSG0000000095970|HPRD：05473|Vega：Otthumg0000000014671 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.1 |
| Pascal P值 | 0.698 |
| Sherlock P值 | 0.629 |
| 胎儿β | -1.433 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04433 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| trem2 | CHR6 | 41129100 | G | 一个 | NM_001271821 NM_018965 |
p.98r> w p.98r> w |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：XU_2012 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17013080 | CHR1 | 208862652 | trem2 | 54209 | 0.09 | 反式 | ||
| RS4844714 | CHR1 | 208874118 | trem2 | 54209 | 0.16 | 反式 | ||
| RS17111391 | Chr10 | 97950485 | trem2 | 54209 | 0.11 | 反式 | ||
| RS767957 | CHR12 | 119038434 | trem2 | 54209 | 0.04 | 反式 | ||
| RS17076272 | CHR13 | 22726361 | trem2 | 54209 | 0.01 | 反式 | ||
| RS17076274 | CHR13 | 22726381 | trem2 | 54209 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | 塔斯 | 10799849 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006959 | 体液免疫反应 | 塔斯 | 10799849 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome其他闪光素相互作用 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Smaphorin相互作用 | 68 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lian Lipa目标6m | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lian Lipa目标3M | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hendricks Smarca4靶向DN | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen Schwannoma Up | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vilimas Notch1靶向DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES LCP带有H3K27Me3 | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |