基因页：SNTG2

概括？
基因 54221
象征 SNTG2
同义词 G2Syn | Syn5
描述 Syntrophinγ2
参考 MIM：608715|HGNC：HGNC：13741|ENSEMBL：ENSG00000172554|HPRD：16374|Vega：Otthumg00000151370
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P25.3
Pascal P值 0.014
胎儿β 0.559
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG11612266 2 947167 SNTG2 1.614E-4 -0.284 0.032 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1514524 CHR8 66321180 SNTG2 54221 0.19 反式
RS4737217 CHR8 66324292 SNTG2 54221 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003779 肌动蛋白结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0030165 PDZ结构域结合 IPI 17292328
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007417 中枢神经系统发展 塔斯 大脑（GO期限：6） 10747910
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016013 综合蛋白复合物 塔斯 神经元（GO期限：8） 10747910
去：0005856 细胞骨架 IEA -
去：0005737 细胞质 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
LastOwska与MYCN二式增长 43 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康（Kang）由tert dn永生 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Finak乳腺癌SDPP签名 26 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因