Summary
GeneID 5426
象征
同义词 CRCS12 | FILS | POL1
描述 聚合酶(DNA)Epsilon,催化亚基
参考 MIM:174762|HGNC:HGNC:9177|ENSEMBL:ENSG00000177084|HPRD:07177|Vega:Otthumg00000168045
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.3
Pascal P值 0.047
胎儿β 1.895
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS5744786 12 133248206 ENSG00000177084.12 3.9832E-7 0.02 15739 gtex_brain_ba24
RS11147012 12 133292745 ENSG00000177084.12 5.57378E-7 0.02 -28800 gtex_brain_ba24
RS4883607 12 133293284 ENSG00000177084.12 6.39522e-7 0.02 -29339 gtex_brain_ba24
RS7486197 12 133293611 ENSG00000177084.12 1.22257E-6 0.02 -29666 gtex_brain_ba24
RS11147017 12 133298215 ENSG00000177084.12 1.56953E-6 0.02 -34270 gtex_brain_ba24
RS11147018 12 133298217 ENSG00000177084.12 1.56953E-6 0.02 -34272 gtex_brain_ba24
RS11147020 12 133301105 ENSG00000177084.12 8.62736E-7 0.02 -37160 gtex_brain_ba24
RS7138235 12 133313237 ENSG00000177084.12 1.6418E-6 0.02 -49292 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG嘧啶代谢 98 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KeGG DNA复制 36 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg基础切除修复 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG核苷酸切除修复 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
复制前复合物的反应组激活 31 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录耦合ner tc ner 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome M G1过渡 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G1 S过渡 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组核苷酸切除修复 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA POL在TC NER中填充间隙填充的Reactome修复合成 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G1 G1 S相 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂M M G1相 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA修复 112 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome全球基因组NER GG NER 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA复制 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome端粒维护 75 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
端粒的Reactome扩展 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome s阶段 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wakasugi有Znf143绑定位点 58 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA中心网络 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和Sufu的Lee目标 53 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌12q24 Amplicon 15 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC 210 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对Serm或Fulvestrant DN的响应 50 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士JAK2瞄准 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标DN 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因