基因页：POLR2E

Summary？
GeneID 5434
Symbol POLR2E
同义词 RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
描述 聚合酶（RNA）II亚基E
参考 MIM：180664|HGNC：HGNC：9192|Ensembl：ENSG0000000099817|HPRD：15946|Vega：Otthumg00000181873
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.3
Pascal P值 0.005
Sherlock P值 0.444
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
Cortex
Frontal Cortex BA9
伏隔核基底神经节
Myers' cis & trans
元

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 eQTL type
rs17019396 CHR3 2763878 POLR2E 5434 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


Section IV. Protein-protein interaction annotation

Interactors 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
C19orf2 FLJ10575 |nnx3 |rmp |Uri 染色体19开放阅读框2 重构的复合物 Biogrid 14615539
C19orf2 FLJ10575 |nnx3 |rmp |Uri 染色体19开放阅读框2 Uriinteracts with RPB5. 绑定 14615539
GTF2F2 BTF4 |Rap30 |TF2F2 |tfiif general transcription factor IIF, polypeptide 2, 30kDa - HPRD，Biogrid 11278533
Med10 L6 | MGC5309 | NUT2 | TRG20 中介复合体亚基10 Affinity Capture-MS Biogrid 15175163
Med19 DT2P1G7 |LCMR1 中介复合体亚基19 Affinity Capture-MS Biogrid 15175163
Med26 CRSP7 |CRSP70 中介复合体亚基26 Affinity Capture-MS Biogrid 15175163
Med29 DKFZP434H247 |ixl 中介复合体亚基29 Affinity Capture-MS Biogrid 15175163
Med9 FLJ10193 | MED25 | MGC138234 中介复合体亚基9 Affinity Capture-MS Biogrid 15175163
nfkbib ikbb |Trip9 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, beta - HPRD 14743216
POLR2A MGC75453 |polr2 |波拉|RPB1 |RPBH1 |RPO2 |rpol2 |rpiils |HRPB220 |HSRPB1 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽A，220KDA POLR2E (hRPB5) interacts with POLR2A (hRPB1). 绑定 9201987
POLR2A MGC75453 |polr2 |波拉|RPB1 |RPBH1 |RPO2 |rpol2 |rpiils |HRPB220 |HSRPB1 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽A，220KDA 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2B POL2RB | RPB2 | hRPB140 | hsRPB2 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽B，140KDA 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2C RPB3 | RPB31 | hRPB33 | hsRPB3 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽C，33KDA HRPB3与HRPB5相互作用。 绑定 10567706
POLR2C RPB3 | RPB31 | hRPB33 | hsRPB3 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽C，33KDA POLR2E (hRPB5) interacts with POLR2C (hRPB3). 绑定 9201987
POLR2C RPB3 | RPB31 | hRPB33 | hsRPB3 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽C，33KDA 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2D HSRBP4 | HSRPB4 | RBP4 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽D HRPB4与HRPB5弱相互作用。 绑定 10567706
POLR2E RPABC1 | RPB5 | XAP4 | hRPB25 | hsRPB5 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽E，25KDA POLR2E (hRPB5)与POLR2E (hRPB5)。 绑定 9201987
POLR2E RPABC1 | RPB5 | XAP4 | hRPB25 | hsRPB5 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽E，25KDA 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2F HRBP14.4 | POLRF | RPABC2 | RPB14.4 | RPB6 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽F POLR2F (hRPB6) interacts with POLR2E (hRPB5). 绑定 9201987
POLR2F HRBP14.4 | POLRF | RPABC2 | RPB14.4 | RPB6 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽F 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2G MGC138367 | MGC138369 | RPB7 | hRPB19 | hsRPB7 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽G HRPB7与HRPB5相互作用。 绑定 10567706
POLR2G MGC138367 | MGC138369 | RPB7 | hRPB19 | hsRPB7 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽G 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2G MGC138367 | MGC138369 | RPB7 | hRPB19 | hsRPB7 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽G POLR2G (hRPB7) interacts with POLR2E (hRPB5). 绑定 9201987
POLR2H RPABC3 | RPB17 | RPB8 | hsRPB8 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽H POLR2H (hRPB8) interacts with POLR2E (hRPB5). 绑定 9201987
POLR2H RPABC3 | RPB17 | RPB8 | hsRPB8 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽H 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2K ABC10-alpha | RPABC4 | RPB10alpha | RPB12 | RPB7.0 | hRPB7.0 | hsRPB10a 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽K，7.0KDA 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2K ABC10-alpha | RPABC4 | RPB10alpha | RPB12 | RPB7.0 | hRPB7.0 | hsRPB10a 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽K，7.0KDA POLR2E（HRPB5）与PolR2K（HRPB10-Alpha）相互作用。 绑定 9201987
POLR2L RBP10 |RPABC5 |RPB10 |rpb10beta |RPB7.6 |HRPB7.6 |HSRPB10B 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽L，7.6KDA 重构的复合物 Biogrid 9201987
POLR2L RBP10 |RPABC5 |RPB10 |rpb10beta |RPB7.6 |HRPB7.6 |HSRPB10B 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽L，7.6KDA POLR2L（HRPB10-BETA）与polr2e（HRPB5）相互作用。 绑定 9201987
POLR3D BN51T |RPC4 |RPC53 |TSBN51 聚合酶（RNA）III（定向DNA）多肽D，44KDA Affinity Capture-MS Biogrid 12391170
Stap1 brdg1 |Stap-1 信号转导适配器家族成员1 Affinity Capture-MS Biogrid 14615539
TAF15 NPL3 |RBP56 |taf2n |tafii68 |HTAFII68 TAF15 RNA聚合酶II，TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，68KDA 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物		 Biogrid 9488465
XRCC5 FLJ39089 |karp-1 |karp1 |ku80 |kub2 |ku86 |nfiv X射线修复补充中国仓鼠细胞5（双链破裂的重新加入）中的缺陷修复 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12393188


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG嘧啶代谢 98 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG RNA POLYMERASE 29 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Huntingtons病 185 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
2型启动子的Reactome RNA Pol III转录启动 23 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome microRNA miRNA生物发生 23 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组调节RNA途径 26 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME RNA POL II TRANSCRIPTION 105 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome RNA Pol III转录 33 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME MRNA CAPPING 30 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome转录耦合ner tc ner 45 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome RNA POL II转录启动和启动子开口 41 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome mRNA处理 161 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome mRNA剪接 111 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome mRNA剪接次要途径 45 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome转录 210 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME NUCLEOTIDE EXCISION REPAIR 51 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME FORMATION OF RNA POL II ELONGATION COMPLEX 45 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome伸长逮捕和恢复 32 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME FORMATION OF TRANSCRIPTION COUPLED NER TC NER REPAIR COMPLEX 30 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME RNA POL I RNA POL III AND MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION 122 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome DNA修复 112 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome RNA Pol II前转录事件 61 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome RNA Pol III转录INITIATION FROM TYPE 3 PROMOTER 26 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME INFLUENZA LIFE CYCLE 203 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME INFLUENZA VIRAL RNA TRANSCRIPTION AND REPLICATION 169 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome HIV感染 207 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME HIV LIFE CYCLE 125 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
在没有TAT的情况下，HIV1转录本的反应组流产伸长 23 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome RNA Pol III转录终止 19 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HIV1早期伸长复合物的反应组形成 34 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome HIV生命周期的后期 104 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome RNA Pol III链伸长 17 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 128 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dairkee Tert目标 380 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼转移DN 261 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UEDA中央时钟 88 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LIN APC目标 77 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SASAKI ADULT T CELL LEUKEMIA 176 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHENG RESPONSE TO NICKEL ACETATE 45 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha PGC 420 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯 491 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yamashita肝癌与Epcam Up 53 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 All SZGR 2.0 genes in this pathway