基因页：GAR1
概括？
| 基因 | 54433 |
| 象征 | GAR1 |
| 同义词 | NOLA1 |
| 描述 | GAR1核糖核蛋白 |
| 参考 | MIM：606468|HGNC：HGNC：14264|ENSEMBL：ENSG00000109534|HPRD：07569|Vega：Otthumg00000161108 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q25 |
| Pascal P值 | 0.38 |
| Sherlock P值 | 0.095 |
| 胎儿β | 0.84 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG17404403 | 4 | 110737017 | GAR1 | 1.75e-5 | -0.377 | 0.016 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | GAR1 | 54433 | 0.09 | 反式 | ||
| RS11930428 | 4 | 110739840 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.464E-7 | 0.01 | 3174 | gtex_brain_ba24 |
| RS71888097 | 4 | 110742136 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.33E-7 | 0.01 | 5470 | gtex_brain_ba24 |
| RS3188897 | 4 | 110745425 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.31E-7 | 0.01 | 8759 | gtex_brain_ba24 |
| RS10365 | 4 | 110745854 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.309E-7 | 0.01 | 9188 | gtex_brain_ba24 |
| RS13128301 | 4 | 110750992 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.151E-7 | 0.01 | 14326 | gtex_brain_ba24 |
| RS35646628 | 4 | 110751439 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.138E-7 | 0.01 | 14773 | gtex_brain_ba24 |
| RS397779561 | 4 | 110755000 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 3.06e-7 | 0.01 | 18334 | gtex_brain_ba24 |
| RS11937249 | 4 | 110755321 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 3.293E-7 | 0.01 | 18655 | gtex_brain_ba24 |
| RS13107617 | 4 | 110757803 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 3.292E-7 | 0.01 | 21137 | gtex_brain_ba24 |
| RS7664699 | 4 | 110760941 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 5.467E-7 | 0.01 | 24275 | gtex_brain_ba24 |
| RS7438763 | 4 | 110763413 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 6.2e-7 | 0.01 | 26747 | gtex_brain_ba24 |
| RS35386791 | 4 | 110764207 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 7.411E-7 | 0.01 | 27541 | gtex_brain_ba24 |
| RS1990250 | 4 | 110770124 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 6.208E-7 | 0.01 | 33458 | gtex_brain_ba24 |
| RS2347129 | 4 | 110771788 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 5.928e-7 | 0.01 | 35122 | gtex_brain_ba24 |
| RS4698797 | 4 | 110773067 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.632E-6 | 0.01 | 36401 | gtex_brain_ba24 |
| RS6533469 | 4 | 110777387 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.944E-6 | 0.01 | 40721 | gtex_brain_ba24 |
| RS7654660 | 4 | 110784379 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.632E-6 | 0.01 | 47713 | gtex_brain_ba24 |
| RS6827802 | 4 | 110788540 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.632E-6 | 0.01 | 51874 | gtex_brain_ba24 |
| RS764205 | 4 | 110790911 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.632E-6 | 0.01 | 54245 | gtex_brain_ba24 |
| RS2159167 | 4 | 110823453 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.001E-6 | 0.01 | 86787 | gtex_brain_ba24 |
| RS7438961 | 4 | 110668651 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.628E-6 | 0.03 | -68015 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4698784 | 4 | 110669261 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.639E-6 | 0.03 | -67405 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11943677 | 4 | 110672770 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.535E-6 | 0.03 | -63896 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4541508 | 4 | 110682487 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 2.047E-6 | 0.03 | -54179 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6533457 | 4 | 110689557 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 2.257E-6 | 0.03 | -47109 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10365 | 4 | 110745854 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 2.404E-6 | 0.03 | 9188 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS397779561 | 4 | 110755000 | GAR1 | ENSG00000109534.12 | 1.687E-6 | 0.03 | 18334 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heidenblad Amplicon 12P11 12 DN | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |