基因页面:SEMA5B
总结吗?
| GeneID | 54437年 |
| 象征 | SEMA5B |
| 同义词 | SEMAG |表 |
| 描述 | semaphorin 5 b |
| 参考 | MIM: 609298|HGNC: HGNC: 10737|运用:ENSG00000082684|HPRD: 15322|织女:OTTHUMG00000140392 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 q21.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.004 |
| 夏洛克假定值 | 0.681 |
| 胎儿β | 1.171 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 皮质 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg04565661 | 3 | 122747440 | SEMA5B | 6.26 e-8 | -0.013 | 1.56 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 国际能源机构 | 神经突(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG轴突引导 | 129年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞SCP2 QTL反式 | 25 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NABA ECM附属 | 171年 | 89年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NABA MATRISOME相关 | 753年 | 411年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NABA MATRISOME | 1028年 | 559年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 133 | 528年 | 535年 | 1、m8 | hsa - mir - 133 a | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU |
| hsa - mir - 133 b | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA | ||||
| mir - 324 - 3 - p | 603年 | 610年 | 1、m8 | hsa - mir - 324 - 3 - p | CCACUGCCCCAGGUGCUGCUGG |
| mir - 365 | 918年 | 924年 | 1 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
| mir - 378 | 837年 | 843年 | 1 | hsa - mir - 378 | CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU |