概括
基因 54468
象征 MIO
同义词 -
描述 缺少卵母细胞,减数分裂调节剂,同源物(果蝇)
参考 MIM:615359|HGNC:HGNC:21905|ENSEMBL:ENSG00000164654|HPRD:07898|Vega:Otthumg00000152440
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p21.3
Pascal P值 0.276
Sherlock P值 0.746
胎儿β 1.001
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
DNM:Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
MIO CHR7 7612732 C G NM_019005 p.209a> g 错过 精神分裂症 DNM:Gulsuner_2013

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21303682 7 7606373 MIO 1.07E-7 0.006 2.34e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3807827 CHR7 8230590 MIO 54468 0.19 顺式
RS6686302 CHR1 18338597 MIO 54468 0.16 反式
RS6586487 CHR1 18339747 MIO 54468 0.08 反式
RS17472583 CHR1 18340024 MIO 54468 0.05 反式
RS17432613 CHR1 18346091 MIO 54468 0.15 反式
RS17433514 CHR1 18395712 MIO 54468 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 83 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染30分钟DN 150 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因