基因页:ZFAND6
概括?
基因 | 54469 |
象征 | ZFAND6 |
同义词 | AWP1 | ZA20D3 | ZFAND5B |
描述 | 锌指AN1型包含6 |
参考 | MIM:610183|HGNC:HGNC:30164|Ensembl:ENSG00000086666|HPRD:18314|Vega:Otthumg00000144169 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q25.1 |
Pascal P值 | 0.001 |
胎儿β | 1.258 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.007 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZFAND6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0008150 | 生物_Process | nd | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005575 | cellular_component | nd | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2向上 | 139 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤DN | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成10 | 30 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 | 162 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 | 128 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Winzen通过KHSRP退化 | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-181 | 79 | 85 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
MiR-200BC/429 | 206 | 212 | 1a | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac | ||||
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
mir-203.1 | 614 | 620 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-214 | 4 | 10 | M8 | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
mir-338 | 6 | 12 | 1a | HSA-MIR-338脑 | uccagauuuuuguuga |
mir-369-3p | 207 | 213 | M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-452 | 33 | 39 | M8 | HSA-MIR-452 | UguuugcaggaaacugagaC |
mir-539 | 335 | 341 | 1a | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |
mir-542-3p | 531 | 537 | 1a | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |