基因页：DGCR8
概括？
| 基因 | 54487 |
| 象征 | DGCR8 |
| 同义词 | c22orf12 | dgcrk6 | gy1 | pasha |
| 描述 | DGCR8微处理器复合物亚基 |
| 参考 | MIM：609030|HGNC：HGNC：2847|ENSEMBL：ENSG00000128191|HPRD：09913|Vega：Otthumg00000150303 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q11.2 |
| Pascal P值 | 7.356E-4 |
| Sherlock P值 | 0.544 |
| 胎儿β | 0.838 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17392743 | CHR1 | 54764240 | DGCR8 | 54487 | 0.01 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | DGCR8 | 54487 | 1.056E-6 | 反式 | ||
| RS3845734 | CHR2 | 171125572 | DGCR8 | 54487 | 0.09 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | DGCR8 | 54487 | 3.289E-4 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | DGCR8 | 54487 | 1.257E-13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003725 | 双链RNA结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15574589 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0031053 | 主要microRNA处理 | 艾达 | 15531877|15574589 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 15574589 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11256614 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome microRNA miRNA生物发生 | 23 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组调节RNA途径 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-205 | 314 | 320 | M8 | HSA-MIR-205 | uccuucauucccggagucug |
| mir-208 | 720 | 726 | 1a | HSA-MIR-208 | auaagacgaaaaaagcuugu |
| mir-499 | 719 | 726 | 1A，M8 | HSA-MIR-499 | uuaagacuugcagugauguuaa |