基因页：Atr
概括？
| 基因 | 545 |
| 象征 | Atr |
| 同义词 | fctcs | frp1 | mec1 | sckl | sckl1 |
| 描述 | ATR丝氨酸/苏氨酸激酶 |
| 参考 | MIM：601215|HGNC：HGNC：882|Ensembl：ENSG00000175054|HPRD：08369|Vega：Otthumg00000159234 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q23 |
| Pascal P值 | 0.799 |
| 胎儿β | -0.454 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4491879 | CHR3 | 189373908 | Atr | 545 | 0.05 | 反式 | ||
| RS4505678 | CHR3 | 189374356 | Atr | 545 | 0.06 | 反式 | ||
| RS16894557 | CHR6 | 28999825 | Atr | 545 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABL1 | ABL |JTK7 |BCR/ABL |c-abl |P150 |V-ABL | C-ABL癌基因1，受体酪氨酸激酶 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| AP1B1 | ADTB1 |AP105A |BAM22 |clapb2 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物1，β1亚基 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| AP2A2 | adtab |clapa2 |hip9 |催眠 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物2，Alpha 2亚基 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| Arhgef1 | GEF1 |lbcl2 |LSC |p115-rhogef |Sub1.5 | Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）1 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| ATM | AT1 |ata |ATC |ATD |ATDC |吃饭|DKFZP781A0353 |MGC74674 |Tel1 |Telo1 | 毛细血管炎突变 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| atmin | Asciz |DKFZP779K1455 |FLJ76795 |KIAA0431 |ZNF822 | ATM互动器 | ATR与ASCIZ相互作用。这种相互作用是建立在酵母ATR和人类ASCIZ之间的相互作用的基础上建模的。 | 绑定 | 15933716 |
| Atr | frp1 |mec1 |sckl |SCKL1 | 共济失调的毛细血管扩张和RAD3相关 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| 一次旅行 | DKFZP762J2115 |FLJ12343 |MGC20625 |MGC21482 |MGC26740 | ATR相互作用的蛋白质 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 生化活动 |
Biogrid | 11721054|14657349 |15210935 |
| BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1，早发 | BRCA1在遗传毒性应激期间与ATR的物理和功能相互作用 | 绑定 | 11016625|11278964 |
| BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1，早发 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 蛋白质肽 重构的复合物 |
Biogrid | 10608806|11016625 |11114888|11278964 |
| BRCA2 | brcc2 |FACD |时尚|Fad1 |Fancb |fancd |FANCD1 | 乳腺癌2，早发 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| CHD4 | DKFZP686E06161 |Mi-2b |mi2-beta | 染色体瘤酶DNA结合蛋白4 | - | HPRD，Biogrid | 10545197 |
| CHEK1 | CHK1 | CHK1检查点同源物（S. Pombe） | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| CHEK1 | CHK1 | CHK1检查点同源物（S. Pombe） | ATR与CHEK1（CHK1）相互作用。 | 绑定 | 15775976 |
| clspn | claspin |MGC131612 |MGC131613 |MGC131615 | claspin同源物（Xenopus laevis） | - | HPRD，Biogrid | 12766152 |
| E4F1 | e4f |MGC99614 | E4F转录因子1 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| EEF1E1 | aimp3 |P18 | 真核翻译伸长因子1 epsilon 1 | P18与ATR相互作用。 | 绑定 | 15680327 |
| HDAC1 | DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰基酶1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10545197 |
| HDAC2 | RPD3 |yaf1 | 组蛋白脱乙酰基酶2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 10545197 |
| Lig4 | - | 连接酶IV，DNA，ATP依赖性 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| MCM2 | BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 | 微型鲜体维护复杂组件2 | 生化活动 | Biogrid | 15210935 |
| MCM7 | CDABP0042 |cdc47 |MCM2 |P1.1-MCM3 |P1CDC47 |p85mcm |PNAS-146 | 微型鲜体维护复杂组件7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15210935 |
| mre11a | atld |HNGS1 |mre11 |mre11b | MRE11减数分裂重组11同源物A（S. cerevisiae） | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| MSH2 | 可口可乐|FCC1 |HNPCC |HNPCC1 |LCFS2 | MUTS同源物2，结肠癌，非型型1型（大肠杆菌） | - | HPRD，Biogrid | 14657349 |
| MTA1 | - | 转移相关1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10545197 |
| MTA2 | DKFZP686F2281 |mta1l1 |pid | 转移相关的1个家庭，成员2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10545197 |
| NBN | AT-V1 |AT-V2 |ATV |FLJ10155 |MGC87362 |NBS |NBS1 |P95 | nbrin | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| NBN | AT-V1 |AT-V2 |ATV |FLJ10155 |MGC87362 |NBS |NBS1 |P95 | nbrin | NBS1与ATR相互作用。 | 绑定 | 15758953 |
| PA2G4 | EBP1 |HG4-1 |P38-2G4 | 增殖相关2G4，38KDA | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| PIK3CA | MGC142161 |MGC142163 |PI3K |p110-alpha | 磷酸肌醇3-激酶，催化，α多肽 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| PML | myl |pp8675 |RNF71 |TRIM19 | Promyelocytic白血病 | ATR磷酸化PML。 | 绑定 | 15195100 |
| pold1 | cdc2 |pold | 聚合酶（导向DNA），三角洲1，催化亚基125KDA | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| PPP2R2A | B55-Alpha |B55A |FLJ26613 |MGC52248 |Pr52a |PR55A | 蛋白质磷酸酶2（以前为2A），调节亚基B，α同工型 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| pts | FLJ97081 |PTPS | 6-曲叶叶二氢蛋白酶合酶 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| RAD17 | CCYC |FLJ41520 |hrad17 |R24L |RAD17SP |RAD24 | RAD17同源物（S. Pombe） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 生化活动 蛋白质肽 |
Biogrid | 10608806|11418864 |
| Rheb | MGC111559 |Rheb2 | 富含大脑的Ras同源物 | ATR与Rheb相互作用。 | 绑定 | 15854902 |
| Rheb | MGC111559 |Rheb2 | 富含大脑的Ras同源物 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15854902 |
| RPA1 | HSSB |repa1 |RF-A |RP-A |RPA70 | 复制蛋白A1，70KDA | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | ATR与TP53（p53）相互作用。 | 绑定 | 15775976 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | 蛋白质肽 重构的复合物 |
Biogrid | 10608806|15159397 |
| Trex1 | AGS1 |AGS5 |CRV |DKFZP434J0310 |drn3 |herns | 三个Prime维修外切酶1 | - | HPRD | 11721054 |
| WRN | DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 | Werner综合征 | 蛋白质肽 | Biogrid | 10608806 |
| XRCC5 | FLJ39089 |karp-1 |karp1 |ku80 |kub2 |ku86 |nfiv | X射线修复补充中国仓鼠细胞5（双链破裂的重新加入）中的缺陷修复 | XRCC5（KU80）与ATR相互作用。 | 绑定 | 15758953 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞周期 | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG P53信号通路 | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta G1途径 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta G2途径 | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Atrbrca途径 | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Fanconi Pathway | 47 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ATR途径 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TCPTP途径 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID昼夜节路 | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID BARD1途径 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID P53调节途径 | 59 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Fanconi贫血途径 | 25 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ATR的反应组激活复制应力 | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G2 M检查点 | 45 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G2 M DNA损伤检查点 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoebeke淋巴干细胞向上 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana乳腺癌点燃int网络 | 101 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| flt3的大风apl突变 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HNE和TBH的Weigel氧化应激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 老化老式的DN | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ehlers neuploidy up | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN | 68 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤DN | 26 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |