基因页:POU2F1
概括?
基因 | 5451 |
象征 | POU2F1 |
同义词 | OCT1 | OTF1 | OCT-1B |
描述 | POU 2级同型1 |
参考 | MIM:164175|HGNC:HGNC:9212|ENSEMBL:ENSG00000143190|HPRD:01250|Vega:Otthumg0000000034436 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q24.2 |
Sherlock P值 | 0.906 |
胎儿β | 1.433 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23087020 | 1 | 167190262 | POU2F1 | 2.57E-5 | 0.406 | 0.017 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17392743 | CHR1 | 54764240 | POU2F1 | 5451 | 0.16 | 反式 | ||
RS823371 | CHR7 | 29648352 | POU2F1 | 5451 | 0.06 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | POU2F1 | 5451 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/POU2F1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ar | AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM | 雄激素受体 | - | HPRD,Biogrid | 10480874 |
Bard1 | - | BRCA1相关环域1 | - | HPRD | 11777930 |
BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1,早发 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11777930 |
BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1,早发 | BRCA1与OCT-1相互作用。 | 绑定 | 11777930 |
EPRS | dkfzp313b047 |耳朵|gluprors |pars |Pig32 |QARS |QPRS | 谷氨酰基 - 丙酰基-TRNA合成酶 | 远西方 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9537509 |
ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | 重构的复合物 | Biogrid | 10480874 |
FDXR | ADXR | 铁蛋白还原酶 | - | HPRD | 11096094 |
gapdh | G3PD |GAPD |MGC88685 | 3-磷酸甘油醛脱氢酶 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12887926 |
HCFC1 | CFF |HCF-1 |HCF1 |HFC1 |MGC70925 |VCAF | 宿主细胞因子C1(VP16-辅助蛋白) | - | HPRD,Biogrid | 8454622 |
HMGB2 | HMG2 | 高机动性组框2 | - | HPRD | 7720710 |
HOXC4 | HOX3 |Hox3e |CP19 | HONEOBOX C4 | - | HPRD | 12672812 |
LIFR | CD118 |FLJ98106 |FLJ99923 |lif-r |SJS2 |stws |SWS | 白血病抑制因子受体α | - | HPRD | 10383413 |
MNAT1 | Mat1 |RNF66 |TFB3 | Menage A Trois同源物1,细胞周期蛋白H装配因子(Xenopus laevis) | - | HPRD,Biogrid | 9368058 |
NCOR2 | CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 | 核受体共抑制剂2 | - | HPRD,Biogrid | 11134019 |
NFYA | CBF-A |CBF-B |FLJ11236 |hap2 |nf-ya | 核转录因子y,alpha | - | HPRD | 11777930 |
NFYA | CBF-A |CBF-B |FLJ11236 |hap2 |nf-ya | 核转录因子y,alpha | OCT-1与NF-YA相互作用 | 绑定 | 11777930 |
npat | E14 | 核蛋白质,共济失调 - 凝集性基因座 | - | HPRD,Biogrid | 12887926 |
NR3C1 | GCCR |GCR |gr |grl | 核受体亚科3,C组,成员1(糖皮质激素受体) | - | HPRD,Biogrid | 9584182|10480874 |10490647|14522952 |
PARP1 | adprt |adprt1 |PARP |PARP-1 |ppol |PADPRT-1 | 聚(ADP-核糖)聚合酶1 | - | HPRD | 9537509 |
PGR | NR3C3 |PR | 孕酮受体 | 重构的复合物 | Biogrid | 10480874 |
POU2AF1 | bob1 |obf-1 |obf1 |OCAB | POU 2类关联因子1 | - | HPRD | 11380252|12727885 |
POU2AF1 | bob1 |obf-1 |obf1 |OCAB | POU 2类关联因子1 | 共晶结构 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9418884|10541551 |11380252 |
POU2F1 | OCT1 |OTF1 | POU 2级同型1 | 共晶结构 | Biogrid | 11583619 |
拉拉 | NR1B1 |RAR | 视黄酸受体,α | 重构的复合物 | Biogrid | 10480874 |
Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 12019209 |
rxra | FLJ00280 |FLJ00318 |FLJ16020 |FLJ16733 |MGC102720 |NR2B1 | 类维生素X受体,α | - | HPRD,Biogrid | 10383413 |
SNAPC4 | FLJ13451 |ptfalpha |SNAP190 | 小核RNA激活复合物,多肽4,190KDA | - | HPRD,Biogrid | 9418884|11856838 |
SOX2 | anop3 |MCOPS3 |MGC2413 | sry(性别确定区域y)-box 2 | - | HPRD | 12923055 |
SP1 | - | SP1转录因子 | - | HPRD,Biogrid | 8668525 |
stip1 | 跳|IEF-SSP-3521 |p60 |sti1 |sti1l | 应力诱导的磷蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12887926 |
TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 8202368 |
thra | AR7 |Ear7 |ERB-T-1 |Erba |erba1 |MGC000261 |MGC43240 |NR1A1 |thra1 |thra2 | c-ERBA-1 | 甲状腺激素受体,α(红细胞性白血病病毒(V-ERB-A)癌基因同源物,Avian) | 重构的复合物 | Biogrid | 10480874 |
TNF | dif |tnf-alpha |tnfa |TNFSF2 | 肿瘤坏死因子(TNF超家族,成员2) | 重构的复合物 | Biogrid | 12019209 |
txnrd1 | Grim-12 |MGC9145 |tr |tr1 |trxr1 |txnr | 硫氧还蛋白还原酶1 | 重构的复合物 | Biogrid | 10383413 |
VDR | NR1I1 | 维生素D(1,25-二羟基维生素D3)受体 | 重构的复合物 | Biogrid | 10383413 |
XRCC5 | FLJ39089 |karp-1 |karp1 |ku80 |kub2 |ku86 |nfiv | X射线修复补充中国仓鼠细胞5(双链破裂的重新加入)中的缺陷修复 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11279128|12393188 |
XRCC6 | CTC75 |CTCBF |G22P1 |ku70 |ML8 |TLAA | X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11279128 |
XRCC6 | CTC75 |CTCBF |G22P1 |ku70 |ML8 |TLAA | X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复6 | - | HPRD | 12672812 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
pid nfat tfpathway | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid reg gr途径 | 82 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AR TF途径 | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ATF2途径 | 59 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCR钙途径 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HNF3A途径 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol III转录 | 33 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol III转录启动来自3型启动子 | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Collis PrkDC底物 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chesler Brain QTL顺式 | 75 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
郭十六进制目标 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼古斯基在乳腺癌中过度连接 | 22 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a Targets Group1 | 136 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |