概括
基因 5451
象征 POU2F1
同义词 OCT1 | OTF1 | OCT-1B
描述 POU 2级同型1
参考 MIM:164175|HGNC:HGNC:9212|ENSEMBL:ENSG00000143190|HPRD:01250|Vega:Otthumg0000000034436
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q24.2
Sherlock P值 0.906
胎儿β 1.433
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23087020 1 167190262 POU2F1 2.57E-5 0.406 0.017 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17392743 CHR1 54764240 POU2F1 5451 0.16 反式
RS823371 CHR7 29648352 POU2F1 5451 0.06 反式
RS16955618 CHR15 29937543 POU2F1 5451 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ar AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM 雄激素受体 - HPRD,Biogrid 10480874
Bard1 - BRCA1相关环域1 - HPRD 11777930
BRCA1 Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 乳腺癌1,早发 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11777930
BRCA1 Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 乳腺癌1,早发 BRCA1与OCT-1相互作用。 绑定 11777930
EPRS dkfzp313b047 |耳朵|gluprors |pars |Pig32 |QARS |QPRS 谷氨酰基 - 丙酰基-TRNA合成酶 远西方
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9537509
ESR1 DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 雌激素受体1 重构的复合物 Biogrid 10480874
FDXR ADXR 铁蛋白还原酶 - HPRD 11096094
gapdh G3PD |GAPD |MGC88685 3-磷酸​​甘油醛脱氢酶 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 12887926
HCFC1 CFF |HCF-1 |HCF1 |HFC1 |MGC70925 |VCAF 宿主细胞因子C1(VP16-辅助蛋白) - HPRD,Biogrid 8454622
HMGB2 HMG2 高机动性组框2 - HPRD 7720710
HOXC4 HOX3 |Hox3e |CP19 HONEOBOX C4 - HPRD 12672812
LIFR CD118 |FLJ98106 |FLJ99923 |lif-r |SJS2 |stws |SWS 白血病抑制因子受体α - HPRD 10383413
MNAT1 Mat1 |RNF66 |TFB3 Menage A Trois同源物1,细胞周期蛋白H装配因子(Xenopus laevis) - HPRD,Biogrid 9368058
NCOR2 CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 核受体共抑制剂2 - HPRD,Biogrid 11134019
NFYA CBF-A |CBF-B |FLJ11236 |hap2 |nf-ya 核转录因子y,alpha - HPRD 11777930
NFYA CBF-A |CBF-B |FLJ11236 |hap2 |nf-ya 核转录因子y,alpha OCT-1与NF-YA相互作用 绑定 11777930
npat E14 核蛋白质,共济失调 - 凝集性基因座 - HPRD,Biogrid 12887926
NR3C1 GCCR |GCR |gr |grl 核受体亚科3,C组,成员1(糖皮质激素受体) - HPRD,Biogrid 9584182|10480874
|10490647|14522952
PARP1 adprt |adprt1 |PARP |PARP-1 |ppol |PADPRT-1 聚(ADP-核糖)聚合酶1 - HPRD 9537509
PGR NR3C3 |PR 孕酮受体 重构的复合物 Biogrid 10480874
POU2AF1 bob1 |obf-1 |obf1 |OCAB POU 2类关联因子1 - HPRD 11380252|12727885
POU2AF1 bob1 |obf-1 |obf1 |OCAB POU 2类关联因子1 共晶结构
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9418884|10541551
|11380252
POU2F1 OCT1 |OTF1 POU 2级同型1 共晶结构 Biogrid 11583619
拉拉 NR1B1 |RAR 视黄酸受体,α 重构的复合物 Biogrid 10480874
Rela MGC131774 |NFKB3 |P65 V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) - HPRD,Biogrid 12019209
rxra FLJ00280 |FLJ00318 |FLJ16020 |FLJ16733 |MGC102720 |NR2B1 类维生素X受体,α - HPRD,Biogrid 10383413
SNAPC4 FLJ13451 |ptfalpha |SNAP190 小核RNA激活复合物,多肽4,190KDA - HPRD,Biogrid 9418884|11856838
SOX2 anop3 |MCOPS3 |MGC2413 sry(性别确定区域y)-box 2 - HPRD 12923055
SP1 - SP1转录因子 - HPRD,Biogrid 8668525
stip1 跳|IEF-SSP-3521 |p60 |sti1 |sti1l 应力诱导的磷蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12887926
TBP gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid 塔塔盒结合蛋白 - HPRD,Biogrid 8202368
thra AR7 |Ear7 |ERB-T-1 |Erba |erba1 |MGC000261 |MGC43240 |NR1A1 |thra1 |thra2 | c-ERBA-1 甲状腺激素受体,α(红细胞性白血病病毒(V-ERB-A)癌基因同源物,Avian) 重构的复合物 Biogrid 10480874
TNF dif |tnf-alpha |tnfa |TNFSF2 肿瘤坏死因子(TNF超家族,成员2) 重构的复合物 Biogrid 12019209
txnrd1 Grim-12 |MGC9145 |tr |tr1 |trxr1 |txnr 硫氧还蛋白还原酶1 重构的复合物 Biogrid 10383413
VDR NR1I1 维生素D(1,25-二羟基维生素D3)受体 重构的复合物 Biogrid 10383413
XRCC5 FLJ39089 |karp-1 |karp1 |ku80 |kub2 |ku86 |nfiv X射线修复补充中国仓鼠细胞5(双链破裂的重新加入)中的缺陷修复 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11279128|12393188
XRCC6 CTC75 |CTCBF |G22P1 |ku70 |ML8 |TLAA X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复6 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11279128
XRCC6 CTC75 |CTCBF |G22P1 |ku70 |ML8 |TLAA X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复6 - HPRD 12672812


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
pid nfat tfpathway 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid reg gr途径 82 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR TF途径 53 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATF2途径 59 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCR钙途径 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HNF3A途径 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol III转录 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol III转录启动来自3型启动子 26 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化 77 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标DN 124 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Collis PrkDC底物 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chesler Brain QTL顺式 75 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制目标 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼古斯基在乳腺癌中过度连接 22 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5A靶向 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a Targets Group1 136 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因