基因页:Tomm7
概括?
基因 | 54543 |
象征 | Tomm7 |
同义词 | tom7 |
描述 | 线粒体膜的易位酶7 |
参考 | MIM:607980|HGNC:HGNC:21648|Ensembl:ENSG00000196683|HPRD:16266|Vega:Otthumg0000000094805 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p15.3 |
Pascal P值 | 0.199 |
Sherlock P值 | 0.924 |
胎儿β | -0.398 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26716323 | 7 | 22862328 | Tomm7 | -0.024 | 0.99 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG15703690 | 7 | 22766992 | Tomm7 | 0.007 | 4.414 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS57158381 | 7 | 22848987 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 4.71E-7 | 0.01 | 13483 | gtex_brain_ba24 |
RS2240728 | 7 | 22852499 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.249E-7 | 0.01 | 9971 | gtex_brain_ba24 |
RS2240727 | 7 | 22852512 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.659E-7 | 0.01 | 9958 | gtex_brain_ba24 |
RS1054471 | 7 | 22852643 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.236E-7 | 0.01 | 9827 | gtex_brain_ba24 |
RS2240726 | 7 | 22853135 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.19e-7 | 0.01 | 9335 | gtex_brain_ba24 |
RS10950922 | 7 | 22854006 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.984e-7 | 0.01 | 8464 | gtex_brain_ba24 |
RS2286507 | 7 | 22854760 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.791E-7 | 0.01 | 7710 | gtex_brain_ba24 |
RS2286506 | 7 | 22854815 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.659E-7 | 0.01 | 7655 | gtex_brain_ba24 |
RS2286505 | 7 | 22854840 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.777E-7 | 0.01 | 7630 | gtex_brain_ba24 |
RS2286504 | 7 | 22854847 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.667E-7 | 0.01 | 7623 | gtex_brain_ba24 |
RS35416658 | 7 | 22855151 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.717E-7 | 0.01 | 7319 | gtex_brain_ba24 |
RS12113458 | 7 | 22855628 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.659E-7 | 0.01 | 6842 | gtex_brain_ba24 |
RS2286503 | 7 | 22856606 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.411E-7 | 0.01 | 5864 | gtex_brain_ba24 |
RS2286501 | 7 | 22856785 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.373E-7 | 0.01 | 5685 | gtex_brain_ba24 |
RS2286499 | 7 | 22857477 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.261E-7 | 0.01 | 4993 | gtex_brain_ba24 |
RS2286498 | 7 | 22857504 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.261E-7 | 0.01 | 4966 | gtex_brain_ba24 |
RS6461669 | 7 | 22858066 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.667E-7 | 0.01 | 4404 | gtex_brain_ba24 |
RS6949233 | 7 | 22858191 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.176E-7 | 0.01 | 4279 | gtex_brain_ba24 |
RS10259561 | 7 | 22859093 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 7.088e-7 | 0.01 | 3377 | gtex_brain_ba24 |
RS4722188 | 7 | 22860211 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.182E-7 | 0.01 | 2259 | gtex_brain_ba24 |
RS4722189 | 7 | 22860474 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.18e-7 | 0.01 | 1996 | gtex_brain_ba24 |
RS4719716 | 7 | 22861369 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.286E-7 | 0.01 | 1101 | gtex_brain_ba24 |
RS981792 | 7 | 22861639 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.19e-7 | 0.01 | 831 | gtex_brain_ba24 |
RS2270108 | 7 | 22862131 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.19e-7 | 0.01 | 339 | gtex_brain_ba24 |
RS2270107 | 7 | 22862183 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 9.337E-8 | 0.01 | 287 | gtex_brain_ba24 |
RS2270105 | 7 | 22862467 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.19e-7 | 0.01 | 3 | gtex_brain_ba24 |
RS2270103 | 7 | 22862722 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.19e-7 | 0.01 | -252 | gtex_brain_ba24 |
RS10276099 | 7 | 22862950 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.19e-7 | 0.01 | -480 | gtex_brain_ba24 |
RS1304431 | 7 | 22865412 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.659E-7 | 0.01 | -2942 | gtex_brain_ba24 |
RS1029740 | 7 | 22873586 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.042e-7 | 0.01 | -11116 | gtex_brain_ba24 |
RS929464 | 7 | 22874770 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 8.659E-7 | 0.01 | -12300 | gtex_brain_ba24 |
RS17724311 | 7 | 22876793 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 2.121E-6 | 0.01 | -14323 | gtex_brain_ba24 |
RS17147344 | 7 | 22880856 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 2.172E-6 | 0.01 | -18386 | gtex_brain_ba24 |
RS57158381 | 7 | 22848987 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 2.749E-7 | 0 | 13483 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2240728 | 7 | 22852499 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 4.045e-7 | 0 | 9971 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1054471 | 7 | 22852643 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 4.071E-7 | 0 | 9827 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2240726 | 7 | 22853135 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 4.173E-7 | 0 | 9335 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4722188 | 7 | 22860211 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.679E-7 | 0 | 2259 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4722189 | 7 | 22860474 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.579E-7 | 0 | 1996 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4719716 | 7 | 22861369 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.119E-7 | 0 | 1101 | gtex_brain_putamen_basal |
RS981792 | 7 | 22861639 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.572E-7 | 0 | 831 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2270108 | 7 | 22862131 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.572E-7 | 0 | 339 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2270107 | 7 | 22862183 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 2.651E-7 | 0 | 287 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2270105 | 7 | 22862467 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.572E-7 | 0 | 3 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2270103 | 7 | 22862722 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.572E-7 | 0 | -252 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10276099 | 7 | 22862950 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 1.572E-7 | 0 | -480 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17147344 | 7 | 22880856 | Tomm7 | ENSG00000196683.6 | 4.636E-7 | 0 | -18386 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TOMM7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组线粒体蛋白进口 | 58 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |