概括
基因 54543
象征 Tomm7
同义词 tom7
描述 线粒体膜的易位酶7
参考 MIM:607980|HGNC:HGNC:21648|Ensembl:ENSG00000196683|HPRD:16266|Vega:Otthumg0000000094805
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p15.3
Pascal P值 0.199
Sherlock P值 0.924
胎儿β -0.398
DMG 2(#研究)
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG26716323 7 22862328 Tomm7 -0.024 0.99 DMG:Nishioka_2013
CG15703690 7 22766992 Tomm7 0.007 4.414 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS57158381 7 22848987 Tomm7 ENSG00000196683.6 4.71E-7 0.01 13483 gtex_brain_ba24
RS2240728 7 22852499 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.249E-7 0.01 9971 gtex_brain_ba24
RS2240727 7 22852512 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.659E-7 0.01 9958 gtex_brain_ba24
RS1054471 7 22852643 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.236E-7 0.01 9827 gtex_brain_ba24
RS2240726 7 22853135 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.19e-7 0.01 9335 gtex_brain_ba24
RS10950922 7 22854006 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.984e-7 0.01 8464 gtex_brain_ba24
RS2286507 7 22854760 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.791E-7 0.01 7710 gtex_brain_ba24
RS2286506 7 22854815 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.659E-7 0.01 7655 gtex_brain_ba24
RS2286505 7 22854840 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.777E-7 0.01 7630 gtex_brain_ba24
RS2286504 7 22854847 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.667E-7 0.01 7623 gtex_brain_ba24
RS35416658 7 22855151 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.717E-7 0.01 7319 gtex_brain_ba24
RS12113458 7 22855628 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.659E-7 0.01 6842 gtex_brain_ba24
RS2286503 7 22856606 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.411E-7 0.01 5864 gtex_brain_ba24
RS2286501 7 22856785 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.373E-7 0.01 5685 gtex_brain_ba24
RS2286499 7 22857477 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.261E-7 0.01 4993 gtex_brain_ba24
RS2286498 7 22857504 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.261E-7 0.01 4966 gtex_brain_ba24
RS6461669 7 22858066 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.667E-7 0.01 4404 gtex_brain_ba24
RS6949233 7 22858191 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.176E-7 0.01 4279 gtex_brain_ba24
RS10259561 7 22859093 Tomm7 ENSG00000196683.6 7.088e-7 0.01 3377 gtex_brain_ba24
RS4722188 7 22860211 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.182E-7 0.01 2259 gtex_brain_ba24
RS4722189 7 22860474 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.18e-7 0.01 1996 gtex_brain_ba24
RS4719716 7 22861369 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.286E-7 0.01 1101 gtex_brain_ba24
RS981792 7 22861639 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.19e-7 0.01 831 gtex_brain_ba24
RS2270108 7 22862131 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.19e-7 0.01 339 gtex_brain_ba24
RS2270107 7 22862183 Tomm7 ENSG00000196683.6 9.337E-8 0.01 287 gtex_brain_ba24
RS2270105 7 22862467 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.19e-7 0.01 3 gtex_brain_ba24
RS2270103 7 22862722 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.19e-7 0.01 -252 gtex_brain_ba24
RS10276099 7 22862950 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.19e-7 0.01 -480 gtex_brain_ba24
RS1304431 7 22865412 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.659E-7 0.01 -2942 gtex_brain_ba24
RS1029740 7 22873586 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.042e-7 0.01 -11116 gtex_brain_ba24
RS929464 7 22874770 Tomm7 ENSG00000196683.6 8.659E-7 0.01 -12300 gtex_brain_ba24
RS17724311 7 22876793 Tomm7 ENSG00000196683.6 2.121E-6 0.01 -14323 gtex_brain_ba24
RS17147344 7 22880856 Tomm7 ENSG00000196683.6 2.172E-6 0.01 -18386 gtex_brain_ba24
RS57158381 7 22848987 Tomm7 ENSG00000196683.6 2.749E-7 0 13483 gtex_brain_putamen_basal
RS2240728 7 22852499 Tomm7 ENSG00000196683.6 4.045e-7 0 9971 gtex_brain_putamen_basal
RS1054471 7 22852643 Tomm7 ENSG00000196683.6 4.071E-7 0 9827 gtex_brain_putamen_basal
RS2240726 7 22853135 Tomm7 ENSG00000196683.6 4.173E-7 0 9335 gtex_brain_putamen_basal
RS4722188 7 22860211 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.679E-7 0 2259 gtex_brain_putamen_basal
RS4722189 7 22860474 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.579E-7 0 1996 gtex_brain_putamen_basal
RS4719716 7 22861369 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.119E-7 0 1101 gtex_brain_putamen_basal
RS981792 7 22861639 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.572E-7 0 831 gtex_brain_putamen_basal
RS2270108 7 22862131 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.572E-7 0 339 gtex_brain_putamen_basal
RS2270107 7 22862183 Tomm7 ENSG00000196683.6 2.651E-7 0 287 gtex_brain_putamen_basal
RS2270105 7 22862467 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.572E-7 0 3 gtex_brain_putamen_basal
RS2270103 7 22862722 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.572E-7 0 -252 gtex_brain_putamen_basal
RS10276099 7 22862950 Tomm7 ENSG00000196683.6 1.572E-7 0 -480 gtex_brain_putamen_basal
RS17147344 7 22880856 Tomm7 ENSG00000196683.6 4.636E-7 0 -18386 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组线粒体蛋白进口 58 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因