基因页面:NECAB2
总结吗?
GeneID | 54550年 |
象征 | NECAB2 |
同义词 | EFCBP2 |
描述 | 氨基类ef - hand钙结合蛋白2 |
参考 | HGNC: HGNC: 23746|运用:ENSG00000103154|HPRD: 13263|织女:OTTHUMG00000137636 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q23.3 |
帕斯卡假定值 | 0.248 |
夏洛克假定值 | 0.894 |
胎儿β | -2.481 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg00021600 | 16 | 84003607 | NECAB2 | 2.806的军医 | 0.856 | 0.039 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
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rs17542055 | chr7 | 42652803 | NECAB2 | 54550年 | 0.15 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NECAB2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CAPN3 | CANP3 | CANPL3 | LGMD2 | LGMD2A | MGC10767 | MGC11121 | MGC14344 | MGC4403 | nCL-1 | p94 | calpain 3 (p94) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CCDC33 | FLJ23168 | FLJ32855 | MGC34145 | 卷曲螺旋域包含33 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CCNK | CPR4 | MGC9113 | 细胞周期蛋白K | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CENPO | CENP-O | MGC11266 | 着丝粒蛋白啊 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
DFFA | DFF-45 | DFF1 | ICAD | DNA分裂因素,45 kda,α多肽 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
DGCR6L | FLJ10666 | 迪格奥尔格综合征基因6的临界区 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
FXR2 | FMR1L2 | 脆性X智力迟钝,常染色体同族体2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
GTPBP10 | DKFZp686A10121 | FLJ38242 | MGC104191 | ObgH2 | UG0751c10 | GTP-binding蛋白10(假定的) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
KIAA1267 | DKFZp686P06109 | DKFZp727C091 | MGC102843 | KIAA1267 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
LNX1 | LNX | MPDZ | PDZRN2 | numb-protein X 1的配体 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
NECAB2 | EFCBP2 | 氨基类ef - hand钙结合蛋白2 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
NEK6 | sid6 - 1512 | 尼玛(不要在有丝分裂的基因)-相关激酶6 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
NOC4L | MGC3162 | NOC4 | 核仁的复杂关联4同族体(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
PSMA1 | HC2 | MGC14542 | MGC14575 | MGC14751 | MGC1667 | MGC21459 | MGC22853 | MGC23915 |女| PROS30 | 蛋白酶体(prosome macropain)亚基,α型,1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
RCOR3 | FLJ10876 | FLJ16298 | rp11 - 318 l16.1 | 其他辅阻遏物3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
RUNX1T1 | AML1T1 | CBFA2T1 | CDR | |埃托奥MGC2796 | MTG8 | MTG8b | ZMYND2 | runt-related转录因子1;转移到1(细胞周期蛋白D-related) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
TEX11 | TGC1 | TSGA3 | 睾丸表示11 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
VTA1 | C6orf55 | DRG-1 | DRG1 | FLJ27228 | HSPC228 | LIP5 | My012 | SBP1 | Vps20-associated 1同族体(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
WDYHV1 | C8orf32 | FLJ10204 | WDYHV主题包含1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡 | 552年 | 347年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和血清剥夺 | 211年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
小山SEMA3B DN的目标 | 411年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
近端树突LEIN本地化 | 37 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李肝癌生存 | 185年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌子类扩散DN | 179年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN HOELZEL NF1目标 | 115年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |