概括
基因 5459
象征 POU4F3
同义词 BRN3C | DFNA15
描述 POU 4级同型3
参考 MIM:602460|HGNC:HGNC:9220|Ensembl:ENSG00000091010|HPRD:03911|Vega:Otthumg00000129684
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q32
Pascal P值 0.745
胎儿β 0.044
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00459
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS695809 CHR22 26278127 POU4F3 5459 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 塔斯 9506947
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0031290 视网膜神经节细胞轴突指导 IEA 轴突,大脑(GO期限:14) -
GO:0048676 轴突扩展参与开发 IEA Axon(GO术语级别:14) -
GO:0051402 神经元细胞凋亡 IEA 神经元,轴突,树突(GO期限:7) -
去:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 IEA -
去:0007605 声音的感官感知 塔斯 9506947
去:0007601 视觉感知 塔斯 7623109
GO:0042472 内耳形态发生 IEA -
GO:0021562 前庭神经发育 IEA -
GO:0050885 神经肌肉过程控制平衡 IEA -
GO:0042491 听觉受体细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Schlesinger H3K27me3在正常状态下甲基化的癌症 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因