基因页:DDX56
概括?
基因 | 54606 |
象征 | DDX56 |
同义词 | ddx21 | ddx26 | noh61 |
描述 | 死盒解旋酶56 |
参考 | MIM:608023|HGNC:HGNC:18193|ENSEMBL:ENSG00000136271|HPRD:12154|Vega:Otthumg00000129211 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p13 |
Pascal P值 | 2.429e-5 |
Sherlock P值 | 0.833 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | DDX56 | 54606 | 0.04 | 反式 | ||
RS16878317 | CHR8 | 31657853 | DDX56 | 54606 | 0.16 | 反式 | ||
RS7020639 | Chr9 | 71907868 | DDX56 | 54606 | 0.14 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | DDX56 | 54606 | 8.836E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DDX56_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
DHX37 | DDX37 |FLJ41974 |KIAA1517 |MGC2695 |MGC4322 |MGC46245 | DEAH(ASP-GLU-ALA-HIS)盒多肽37 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
DHX57 | DDX57 |FLJ32861 | DEAH(ASP-GLU-ALA-ASP/HIS)盒多肽57 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
fbl | fib |flrn |RNU3IP1 | 纤维林 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
FTSJ3 | EPCS3 |FLJ20062 | FTSJ同源物3(大肠杆菌) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
GNL2 | FLJ40906 |Humauantig |NGP1 |NGP-1 |DJ423B22.6 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白样2(核仁) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
Hist1H2BC | H2B.1 |H2B/L |H2BFL |MGC104246 |DJ221C16.3 | 组蛋白簇1,H2BC | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPL43 | MGC17989 |MGC48892 |bmrp36a | 线粒体核糖体蛋白L43 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPS14 | DJ262D12.2 |HSMRPS14 |MRP-S14 | 线粒体核糖体蛋白S14 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPS24 | HSPC335 |MRP-S24 | 线粒体核糖体蛋白S24 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPS25 | dkfzp313H0817 |FLJ00023 |MRP-S25 |rpms25 | 线粒体核糖体蛋白S25 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPS34 | MGC2616 |MRP-S12 |MRP-S34 |MRPS12 | 线粒体核糖体蛋白S34 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPS5 | MRP-S5 |S5MT | 线粒体核糖体蛋白S5 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPS9 | MRP-S9 |rpms9 |S9MT | 线粒体核糖体蛋白S9 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
mybbp1a | FLJ37886 |P160 |pap2 | MYB结合蛋白(P160)1A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL18A | - | 核糖体蛋白L18A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL23A | FLJ27455 |MDA20 | 核糖体蛋白L23A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL26 | - | 核糖体蛋白L26 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL29 | 臀部|humrpl29 |MGC88589 | 核糖体蛋白L29 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL31 | MGC88191 | 核糖体蛋白L31 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL34 | MGC111005 | 核糖体蛋白L34 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL37 | DKFZP686G1699 |MGC99572 | 核糖体蛋白L37 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPS11 | - | 核糖体蛋白S11 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPS16 | - | 核糖体蛋白S16 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPS29 | - | 核糖体蛋白S29 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPS3A | fte1 |mftl |MGC23240 | 核糖体蛋白S3A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPS9 | - | 核糖体蛋白S9 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RRP12 | DKFZP762P1116 |FLJ20231 |KIAA0690 | 核糖体RNA加工12个同源物(S. cerevisiae) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
SRP14 | alurbp |MGC14326 | 信号识别粒子14KDA(同源ALU RNA结合蛋白) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
USP33 | KIAA1097 |MGC16868 |VDU1 | 泛素特异性肽酶33 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周TNF信号30分钟 | 54 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制肌肉DN | 51 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质癌与腺瘤 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |