概括
基因 54606
象征 DDX56
同义词 ddx21 | ddx26 | noh61
描述 死盒解旋酶56
参考 MIM:608023|HGNC:HGNC:18193|ENSEMBL:ENSG00000136271|HPRD:12154|Vega:Otthumg00000129211
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p13
Pascal P值 2.429e-5
Sherlock P值 0.833
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 DDX56 54606 0.04 反式
RS16878317 CHR8 31657853 DDX56 54606 0.16 反式
RS7020639 Chr9 71907868 DDX56 54606 0.14 反式
RS16955618 CHR15 29937543 DDX56 54606 8.836E-4 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
DHX37 DDX37 |FLJ41974 |KIAA1517 |MGC2695 |MGC4322 |MGC46245 DEAH(ASP-GLU-ALA-HIS)盒多肽37 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
DHX57 DDX57 |FLJ32861 DEAH(ASP-GLU-ALA-ASP/HIS)盒多肽57 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
fbl fib |flrn |RNU3IP1 纤维林 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
FTSJ3 EPCS3 |FLJ20062 FTSJ同源物3(大肠杆菌) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
GNL2 FLJ40906 |Humauantig |NGP1 |NGP-1 |DJ423B22.6 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白样2(核仁) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
Hist1H2BC H2B.1 |H2B/L |H2BFL |MGC104246 |DJ221C16.3 组蛋白簇1,H2BC 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPL43 MGC17989 |MGC48892 |bmrp36a 线粒体核糖体蛋白L43 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPS14 DJ262D12.2 |HSMRPS14 |MRP-S14 线粒体核糖体蛋白S14 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPS24 HSPC335 |MRP-S24 线粒体核糖体蛋白S24 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPS25 dkfzp313H0817 |FLJ00023 |MRP-S25 |rpms25 线粒体核糖体蛋白S25 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPS34 MGC2616 |MRP-S12 |MRP-S34 |MRPS12 线粒体核糖体蛋白S34 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPS5 MRP-S5 |S5MT 线粒体核糖体蛋白S5 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPS9 MRP-S9 |rpms9 |S9MT 线粒体核糖体蛋白S9 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
mybbp1a FLJ37886 |P160 |pap2 MYB结合蛋白(P160)1A 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL18A - 核糖体蛋白L18A 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL23A FLJ27455 |MDA20 核糖体蛋白L23A 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL26 - 核糖体蛋白L26 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL29 臀部|humrpl29 |MGC88589 核糖体蛋白L29 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL31 MGC88191 核糖体蛋白L31 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL34 MGC111005 核糖体蛋白L34 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL37 DKFZP686G1699 |MGC99572 核糖体蛋白L37 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPS11 - 核糖体蛋白S11 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPS16 - 核糖体蛋白S16 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPS29 - 核糖体蛋白S29 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPS3A fte1 |mftl |MGC23240 核糖体蛋白S3A 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPS9 - 核糖体蛋白S9 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RRP12 DKFZP762P1116 |FLJ20231 |KIAA0690 核糖体RNA加工12个同源物(S. cerevisiae) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
SRP14 alurbp |MGC14326 信号识别粒子14KDA(同源ALU RNA结合蛋白) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
USP33 KIAA1097 |MGC16868 |VDU1 泛素特异性肽酶33 两个杂交 Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周TNF信号30分钟 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheng由雌二醇印记 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质癌与腺瘤 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因