基因页:PPA1
概括?
基因 | 5464 |
象征 | PPA1 |
同义词 | HEL-S-66P | IOPPP | PP | PP1 | SID6-8061 |
描述 | 焦磷酸酶(无机)1 |
参考 | MIM:179030|HGNC:HGNC:9226|ENSEMBL:ENSG00000180817|HPRD:01527|Vega:Otthumg0000000018399 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q22.1 |
Pascal P值 | 0.289 |
Sherlock P值 | 0.708 |
胎儿β | 0.189 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 皮质 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15097876 | 10 | 71993604 | PPA1 | -0.024 | 0.39 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG02567788 | 10 | 71992279 | PPA1 | 3.78e-8 | -0.021 | 1.09E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPA1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PRPF6 | 0.96 | 0.96 |
PJA1 | 0.96 | 0.96 |
PGD | 0.96 | 0.95 |
hnrnpab | 0.95 | 0.97 |
EIF4A3 | 0.95 | 0.94 |
PES1 | 0.95 | 0.96 |
tubb2b | 0.95 | 0.78 |
ZNF821 | 0.95 | 0.94 |
setDB1 | 0.95 | 0.94 |
WDR70 | 0.95 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.79 | -0.82 |
AF347015.31 | -0.78 | -0.90 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.90 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.90 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.90 |
C5orf53 | -0.77 | -0.77 |
TSC22D4 | -0.76 | -0.83 |
AIFM3 | -0.76 | -0.79 |
FXYD1 | -0.76 | -0.88 |
S100B | -0.76 | -0.84 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胞质tRNA氨基酰化 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome tRNA氨基酰化 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁与HDAC互动 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rahman TP53靶向磷酸化 | 21 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戈德拉斯体内平衡增殖 | 171 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
zamora nos2靶向 | 69 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成5 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Burton脂肪形成峰在8小时 | 39 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江式下丘脑老化 | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iritani mad1靶向DN | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD2 DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |