概括
基因 5464
象征 PPA1
同义词 HEL-S-66P | IOPPP | PP | PP1 | SID6-8061
描述 焦磷酸酶(无机)1
参考 MIM:179030|HGNC:HGNC:9226|ENSEMBL:ENSG00000180817|HPRD:01527|Vega:Otthumg0000000018399
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q22.1
Pascal P值 0.289
Sherlock P值 0.708
胎儿β 0.189
DMG 2(#研究)
主持人 尾状基底神经节
皮质

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15097876 10 71993604 PPA1 -0.024 0.39 DMG:Nishioka_2013
CG02567788 10 71992279 PPA1 3.78e-8 -0.021 1.09E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PRPF6 0.96 0.96
PJA1 0.96 0.96
PGD 0.96 0.95
hnrnpab 0.95 0.97
EIF4A3 0.95 0.94
PES1 0.95 0.96
tubb2b 0.95 0.78
ZNF821 0.95 0.94
setDB1 0.95 0.94
WDR70 0.95 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.79 -0.82
AF347015.31 -0.78 -0.90
AF347015.27 -0.77 -0.90
MT-CO2 -0.77 -0.90
AF347015.33 -0.77 -0.90
C5orf53 -0.77 -0.77
TSC22D4 -0.76 -0.83
AIFM3 -0.76 -0.79
FXYD1 -0.76 -0.88
S100B -0.76 -0.84

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胞质tRNA氨基酰化 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome tRNA氨基酰化 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁与HDAC互动 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rahman TP53靶向磷酸化 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
zamora nos2靶向 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Burton脂肪形成峰在8小时 39 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江式下丘脑老化 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iritani mad1靶向DN 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD2 DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因