基因页：kif1a
概括？
| 基因 | 547 |
| 象征 | kif1a |
| 同义词 | ATSV | C2orf20 | HSN2C | MRD9 | SPG30 | UNC104 |
| 描述 | 动机家庭成员1A |
| 参考 | MIM：601255|HGNC：HGNC：888|Ensembl：ENSG00000130294|HPRD：03156|Vega：Otthumg00000151940 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q37.3 |
| Pascal P值 | 0.618 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | 细胞内贩运 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| kif1a | CHR2 | 241658510 | G | t | NM_001244008 NM_004321 |
p.1709n> k p.1608n> k |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03896836 | 2 | 241760025 | kif1a | 8.89e-6 | -0.493 | 0.013 | DMG：Wockner_2014 |
| CG17500202 | 2 | 241722099 | kif1a | 1.107E-4 | 0.514 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
| CG27378591 | 2 | 241697024 | kif1a | 4.164E-4 | 0.513 | 0.044 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| tusc4 | 0.91 | 0.89 |
| CHKB | 0.87 | 0.87 |
| COQ6 | 0.87 | 0.84 |
| 双子座7 | 0.84 | 0.80 |
| commd4 | 0.84 | 0.84 |
| mpdu1 | 0.83 | 0.80 |
| RNF25 | 0.83 | 0.84 |
| HDHD3 | 0.83 | 0.78 |
| OVCA2 | 0.83 | 0.86 |
| mtx1 | 0.83 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-ATP8 | -0.52 | -0.63 |
| AF347015.8 | -0.51 | -0.56 |
| AF347015.18 | -0.50 | -0.60 |
| AF347015.26 | -0.50 | -0.58 |
| mt-cyb | -0.49 | -0.55 |
| AF347015.2 | -0.49 | -0.55 |
| AF347015.15 | -0.49 | -0.54 |
| AF347015.27 | -0.49 | -0.56 |
| ptrf | -0.47 | -0.49 |
| MT-CO2 | -0.46 | -0.51 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003777 | 微管运动活动 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008089 | 顺行轴突货运运输 | 塔斯 | 轴突（GO术语级别：9） | 7539720 |
| 去：0007018 | 基于微管的运动 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005874 | 微管 | IEA | - | |
| 去：0005875 | 微管相关的复合物 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄端癌症 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lian Lipa目标6m | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由HPV31 DN永生 | 65 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标 | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen滑膜肉瘤 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-101 | 3535 | 3541 | M8 | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
| mir-141/200a | 3515 | 3521 | 1a | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||