基因页:PPEF2
概括?
基因 | 5470 |
象征 | PPEF2 |
同义词 | PPP7CB |
描述 | 具有EF手域2的蛋白质磷酸酶 |
参考 | MIM:602256|HGNC:HGNC:9244|Ensembl:ENSG00000156194|HPRD:03771|Vega:Otthumg00000160915 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q21.1 |
Pascal P值 | 0.127 |
胎儿β | 0.86 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPEF2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DMKN | 0.82 | 0.35 |
GOLT1A | 0.75 | 0.60 |
BATF | 0.71 | 0.34 |
C20ORF27 | 0.70 | 0.54 |
TMEM90A | 0.70 | 0.52 |
RGS14 | 0.69 | 0.67 |
TAC1 | 0.69 | 0.73 |
AP003108.2 | 0.69 | 0.50 |
TMEM45A | 0.69 | 0.33 |
RGS9 | 0.68 | 0.34 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC016910.1 | -0.29 | -0.27 |
FAM13A | -0.27 | -0.27 |
Zeb2 | -0.26 | -0.37 |
ZNF238 | -0.26 | -0.20 |
DPP4 | -0.26 | -0.22 |
limch1 | -0.25 | -0.37 |
尖峰1 | -0.25 | -0.27 |
EFNB2 | -0.25 | -0.22 |
GPR22 | -0.25 | -0.14 |
Dact1 | -0.25 | -0.12 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI葡萄糖剥夺 | 60 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |