概括
基因 5470
象征 PPEF2
同义词 PPP7CB
描述 具有EF手域2的蛋白质磷酸酶
参考 MIM:602256|HGNC:HGNC:9244|Ensembl:ENSG00000156194|HPRD:03771|Vega:Otthumg00000160915
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q21.1
Pascal P值 0.127
胎儿β 0.86
主持人 小脑半球
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DMKN 0.82 0.35
GOLT1A 0.75 0.60
BATF 0.71 0.34
C20ORF27 0.70 0.54
TMEM90A 0.70 0.52
RGS14 0.69 0.67
TAC1 0.69 0.73
AP003108.2 0.69 0.50
TMEM45A 0.69 0.33
RGS9 0.68 0.34
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC016910.1 -0.29 -0.27
FAM13A -0.27 -0.27
Zeb2 -0.26 -0.37
ZNF238 -0.26 -0.20
DPP4 -0.26 -0.22
limch1 -0.25 -0.37
尖峰1 -0.25 -0.27
EFNB2 -0.25 -0.22
GPR22 -0.25 -0.14
Dact1 -0.25 -0.12

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI葡萄糖剥夺 60 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因