基因页：RRN3
概括？
| 基因 | 54700 |
| 象征 | RRN3 |
| 同义词 | A-270G1.2 | Tifia |
| 描述 | RRN3同源物，RNA聚合酶I转录因子 |
| 参考 | MIM：605121|HGNC：HGNC：30346|Ensembl：ENSG00000085721|HPRD：12004|Vega：Otthumg00000129847 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p12 |
| Pascal P值 | 1.961E-5 |
| Sherlock P值 | 0.689 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7404450 | CHR16 | 14450653 | RRN3 | 54700 | 0.08 | 顺式 | ||
| RS8014005 | CHR14 | 48182689 | RRN3 | 54700 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003701 | RNA聚合酶I转录因子活性 | 塔斯 | 10758157 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006360 | RNA聚合酶I启动子的转录 | 塔斯 | 10758157 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 动作 | PS1TP5BP1 | Actin，Beta | TIF-IA与肌动蛋白相互作用。 | 绑定 | 15558034 |
| CCNE1 | CCNE | 细胞周期蛋白E1 | 重构的复合物 | Biogrid | 15004009 |
| CDK2 | p33（CDK2） | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | 重构的复合物 | Biogrid | 15004009 |
| EIF3EIP | EIF3S11 |EIF3S6IP |HSPC021 |HSPC025 |MSTP005 | 真核翻译起始因子3，亚基E相互作用蛋白 | TIF-IA与PAF67相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类TIF-IA和PAF67之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12393749 |
| myo1c | FLJ23903 |mmi-beta |mmib |NMI |myr2 | 肌球蛋白IC | NMI与TIF-IA相互作用。 | 绑定 | 15558034 |
| polr1a | DKFZP586M0122 |FLJ21915 |MGC87965 |RPA1 |RPO1-4 | 聚合酶（RNA）I多肽A，194KDA | - | HPRD，Biogrid | 11250903 |
| polr1a | DKFZP586M0122 |FLJ21915 |MGC87965 |RPA1 |RPO1-4 | 聚合酶（RNA）I多肽A，194KDA | TIF-IA与RPA43相互作用。这种相互作用是在人类TIF-IA和小鼠RPA43之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 12393749 |
| polr1b | FLJ10816 |FLJ21921 |MGC131780 |RPA135 |RPA2 |RPO1-2 | 聚合酶（RNA）I多肽B，128KDA | pol I与Tif-ia相互作用。 | 绑定 | 15558034 |
| polr1b | FLJ10816 |FLJ21921 |MGC131780 |RPA135 |RPA2 |RPO1-2 | 聚合酶（RNA）I多肽B，128KDA | - | HPRD | 11250903 |
| PPP2R2A | B55-Alpha |B55A |FLJ26613 |MGC52248 |Pr52a |PR55A | 蛋白质磷酸酶2（以前为2A），调节亚基B，α同工型 | 重构的复合物 | Biogrid | 15004009 |
| 肋骨 | - | rRNA启动子结合蛋白 | TIF-IA与rDNA相互作用。 | 绑定 | 15558034 |
| taf1a | MGC：17061 |rafi48 |SL1 |TAFI48 | TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，RNA聚合酶I，A，48KDA | - | HPRD，Biogrid | 11250903 |
| taf1b | MGC：9349 |raf1b |Rafi63 |SL1 |TAFI63 | TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，RNA聚合酶I，B，63KDA | - | HPRD，Biogrid | 11250903 |
| taf1b | MGC：9349 |raf1b |Rafi63 |SL1 |TAFI63 | TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，RNA聚合酶I，B，63KDA | TIF-IA与TAFI68相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类TIF-IA和TAFI68之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12393749 |
| taf1c | MGC：39976 |SL1 |TAFI110 |TAFI95 | TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，RNA聚合酶I，C，110KDA | - | HPRD，Biogrid | 11250903 |
| taf1c | MGC：39976 |SL1 |TAFI110 |TAFI95 | TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，RNA聚合酶I，C，110KDA | TIF-IA与TAFI95相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类TIF-IA和TAFI95之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12393749 |
| TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11250903 |
| UBTF | Nor-90 |UBF | 上游结合转录因子RNA聚合酶I | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11250903 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录启动 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |