基因页面:LY6K
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| GeneID | 54742年 |
| 象征 | LY6K |
| 同义词 | CT97 | HSJ001348 | URLC10 | ly-6K |
| 描述 | 淋巴细胞抗原6复杂轨迹K |
| 参考 | MIM: 615093|HGNC: HGNC: 24225|HPRD: 17457| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 q24.3 |
| 帕斯卡假定值 | 3.301的军医 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2976384 | 8 | 143752994 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 5.517 e - | 0 | -28535年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2920288 | 8 | 143753289 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 3.854 e-8 | 0 | -28240年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2920286 | 8 | 143754728 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 6.871 e - | 0 | -26801年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2978977 | 8 | 143755720 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.823 e-6 | 0 | -25809年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs2920284 | 8 | 143756919 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.304 e-6 | 0 | -24610年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs2585152 | 8 | 143786214 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 8.32 e-9 | 0 | 4685年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs2572908 | 8 | 143802636 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 3.581 e-8 | 0 | 21107年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2717603 | 8 | 143803193 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 8.57 e-13 | 0 | 21664年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13250661 | 8 | 143804134 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.702 e-8 | 0 | 22605年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2717602 | 8 | 143805683 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.434 e-9 | 0 | 24154年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs60429799 | 8 | 143806069 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 7.99 e-13 | 0 | 24540年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2585141 | 8 | 143806343 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.807 e-8 | 0 | 24814年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2572909 | 8 | 143806464 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 7.838 e-13 | 0 | 24935年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2585140 | 8 | 143806896 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 7.681 e-13 | 0 | 25367年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2717601 | 8 | 143807924 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 5.364 e-13 | 0 | 26395年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2585139 | 8 | 143808175 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.839平台以及 | 0 | 26646年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2257796 | 8 | 143808667 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 6.036 e-13 | 0 | 27138年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2585138 | 8 | 143808951 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.113 e-12 | 0 | 27422年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2257840 | 8 | 143809193 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.999 e-11 | 0 | 27664年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2585136 | 8 | 143812141 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.831平台以及 | 0 | 30612年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11780127 | 8 | 143813513 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.503 e-6 | 0 | 31984年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2717600 | 8 | 143813988 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.677 e-9 | 0 | 32459年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2585135 | 8 | 143814193 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.037 e-9 | 0 | 32664年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10087426 | 8 | 143814554 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.091 e - | 0 | 33025年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11785290 | 8 | 143814849 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.05 e - | 0 | 33320年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10624245 | 8 | 143815697 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4 e-9 | 0 | 34168年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3736010 | 8 | 143817503 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.169 e - | 0 | 35974年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3736011 | 8 | 143817789 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.984 e - | 0 | 36260年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10956985 | 8 | 143818750 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.295 e - | 0 | 37221年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7828042 | 8 | 143819383 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.98 e - | 0 | 37854年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12543368 | 8 | 143819450 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.45 e - | 0 | 37921年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10110970 | 8 | 143820410 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.98 e - | 0 | 38881 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34956412 | 8 | 143822028 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.338 e - | 0 | 40499年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4736321 | 8 | 143822194 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.32 e - | 0 | 40665年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4736322 | 8 | 143822208 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.965 e - | 0 | 40679年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13254346 | 8 | 143823863 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.98 e - | 0 | 42334年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13254358 | 8 | 143823876 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.254 e - | 0 | 42347年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3758081 | 8 | 143824373 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.338 e - | 0 | 42844年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3758082 | 8 | 143824483 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.98 e - | 0 | 42954年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7010768 | 8 | 143825951 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 3.309 e - | 0 | 44422年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs141156042 | 8 | 143825981 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.479 e - | 0 | 44452年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4736300 | 8 | 143829269 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.338 e - | 0 | 47740年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4736301 | 8 | 143829499 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.203 e - | 0 | 47970年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4736323 | 8 | 143830359 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.338 e - | 0 | 48830年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4736324 | 8 | 143830462 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.034 e - | 0 | 48933年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2572876 | 8 | 143830599 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 4.235 e - | 0 | 49070年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2016749 | 8 | 143836118 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 6.755平台以及 | 0 | 54589年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2572874 | 8 | 143837219 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 7.52平台以及 | 0 | 55690年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10108887 | 8 | 143837749 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.946 e-9 | 0 | 56220年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7813604 | 8 | 143838062 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 6.611平台以及 | 0 | 56533年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13259549 | 8 | 143838519 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 5.902平台以及 | 0 | 56990年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13279795 | 8 | 143838669 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.554 e-9 | 0 | 57140年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2099464 | 8 | 143839163 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.775 e - | 0 | 57634年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs72543656 | 8 | 143839323 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 5.324平台以及 | 0 | 57794年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs35489125 | 8 | 143839324 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 6.656平台以及 | 0 | 57795年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs28576258 | 8 | 143841249 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.475 e-9 | 0 | 59720年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6992585 | 8 | 143842689 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.164平台以及 | 0 | 61160年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1036385 | 8 | 143842901 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.544 e-9 | 0 | 61372年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13275873 | 8 | 143843302 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.484 e-9 | 0 | 61773年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10094888 | 8 | 143843834 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 7.983 e-9 | 0 | 62305年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7000648 | 8 | 143844051 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 5.031 e-9 | 0 | 62522年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7013131 | 8 | 143844210 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.418 e-8 | 0 | 62681年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11991937 | 8 | 143844458 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.753 e-8 | 0 | 62929年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7012804 | 8 | 143844650 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 9.532 e-8 | 0 | 63121年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7005423 | 8 | 143844661 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 6.343 e-9 | 0 | 63132年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7005613 | 8 | 143844819 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 6.764 e-9 | 0 | 63290年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7005927 | 8 | 143845023 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 7.366 e-9 | 0 | 63494年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7822193 | 8 | 143845269 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 8.188 e-9 | 0 | 63740年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7812623 | 8 | 143845449 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.805 e - | 0 | 63920年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7825980 | 8 | 143845459 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.868 e - | 0 | 63930年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7816480 | 8 | 143845714 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 2.699 e-8 | 0 | 64185年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13276915 | 8 | 143850858 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.381 e-6 | 0 | 69329年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs62525624 | 8 | 143852588 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.414 e-6 | 0 | 71059年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs60714144 | 8 | 143867157 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.319 e-6 | 0 | 85628年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2572924 | 8 | 143869114 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 5.463 e - | 0 | 87585年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10956986 | 8 | 143886601 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.859 e - | 0 | 105072年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10956987 | 8 | 143886613 | LY6K | ENSG00000160886.9 | 1.859 e - | 0 | 105084年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区外围和中心 | 285年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌8 q23处抓起扩增子 | 157年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DURCHDEWALD皮肤致癌DN | 264年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN FOXP3目标集群P2 | 79年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES HCP H3 UNMETHYLATED | 63年 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3 UNMETHYLATED | 228年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN CHYLA CBFA2T3目标 | 242年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SERVITJA肝脏HNF1A目标 | 135年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |