基因页面:ZRANB1
总结吗?
| GeneID | 54764年 |
| 象征 | ZRANB1 |
| 同义词 | TRABID |
| 描述 | 锌指RANBP2-type包含1 |
| 参考 | MIM: 611749|HGNC: HGNC: 18224|运用:ENSG00000019995|HPRD: 11738|织女:OTTHUMG00000019223 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10 q26.13 |
| 帕斯卡假定值 | 0.778 |
| 夏洛克假定值 | 0.986 |
| 胎儿β | 0.275 |
| eGene | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03487 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2114835 | chr10 | 126630556 | ZRANB1 | 54764年 | 2.848的军医 | 独联体 | ||
| rs3906796 | chr10 | 126673997 | ZRANB1 | 54764年 | 1.769的军医 | 独联体 | ||
| rs920513 | chr1 | 120272605 | ZRANB1 | 54764年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs16925800 | chr9 | 10315192 | ZRANB1 | 54764年 | 0.15 | 反式 | ||
| rs10122762 | chr9 | 24382971 | ZRANB1 | 54764年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs2114835 | chr10 | 126630556 | ZRANB1 | 54764年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs3906796 | chr10 | 126673997 | ZRANB1 | 54764年 | 0.02 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 11463333 | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 11463333 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11463333 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTORIATI MDM4目标神经上皮DN | 164年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 短期伊万诺娃造血干细胞 | 32 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| gabriele MIR21目标 | 289年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 135 | 2180年 | 2186年 | 1 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir - 138 | 322年 | 328年 | 1 | hsa - mir - 138大脑 | AGCUGGUGUUGUGAAUC |
| mir - 335 | 2161年 | 2168年 | 1、m8 | hsa - mir - 335大脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUGU |
| mir - 361 | 1229年 | 1235年 | 1 | hsa - mir - 361大脑 | UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC |
| mir - 375 | 569年 | 575年 | 1 | hsa - mir - 375 | UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA |
| 米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 1235年 | 1241年 | m8 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
| hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
| hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
| hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
| hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
| hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
| hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
| hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
| hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU | ||||