基因页:PPP1R12C
概括?
基因 | 54776 |
象征 | PPP1R12C |
同义词 | leng3 | mbs85 | p84 | p85 |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节亚基12C |
参考 | MIM:613245|HGNC:HGNC:14947|Ensembl:ENSG00000125503|HPRD:11452|Vega:Otthumg00000180540 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.42 |
Pascal P值 | 0.222 |
Sherlock P值 | 0.139 |
胎儿β | -0.345 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02474116 | 19 | 55625184 | PPP1R12C | 3.393E-4 | -0.368 | 0.041 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2794236 | CHR13 | 81289432 | PPP1R12C | 54776 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R12C_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化hemgn | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 | 83 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO或伽马辐射 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |