概括
基因 54776
象征 PPP1R12C
同义词 leng3 | mbs85 | p84 | p85
描述 蛋白质磷酸酶1调节亚基12C
参考 MIM:613245|HGNC:HGNC:14947|Ensembl:ENSG00000125503|HPRD:11452|Vega:Otthumg00000180540
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.42
Pascal P值 0.222
Sherlock P值 0.139
胎儿β -0.345
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02474116 19 55625184 PPP1R12C 3.393E-4 -0.368 0.041 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2794236 CHR13 81289432 PPP1R12C 54776 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化hemgn 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 83 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO或伽马辐射 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因