概括?
GeneID 5478
Symbol PPIA
Synonyms CYPA | Cyph | Hel-S-69p
描述 peptidylprolyl isomerase A
参考 MIM:123840|HGNC:HGNC:9253|Ensembl:ENSG00000196262|HPRD:00457|HPRD:17376|Vega:OTTHUMG00000023687
Gene type protein-coding
Map location 7p13
Pascal p-value 0.001
Fetal beta 0.521
eGene Meta
Support RNA AND PROTEIN SYNTHESIS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details
Network 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.1128

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
PRKCZ 0.79 0.77
MRPS9 0.79 0.75
YARS 0.78 0.76
UQCC 0.77 0.79
MRPL18 0.77 0.73
DNAJC7 0.77 0.73
NUDT9 0.76 0.73
BECN1 0.76 0.73
ARF3 0.75 0.80
atp6v1d 0.75 0.82
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.18 -0.53 -0.20
AF347015.2 -0.49 -0.23
AF347015.21 -0.49 -0.16
AF347015.26 -0.46 -0.21
AF347015.8 -0.45 -0.21
MT-CO2 -0.45 -0.22
AF347015.15 -0.43 -0.23
AF347015.31 -0.43 -0.23
MYLK2 -0.42 -0.40
NOSTRIN -0.42 -0.20

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0003755 肽酰 - 丙酰基传播异构酶活性 IEA -
GO:0016853 isomerase activity IEA -
GO:0042277 肽结合 IEA -
GO:0051082 unfolded protein binding 塔斯 2644542
GO:0046790 virion binding NAS 11250896
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006457 protein folding IEA -
GO:0006457 protein folding 塔斯 2179953|2644542
GO:0019047 探测活动的整合 EXP 16291214
GO:0019059 initiation of viral infection EXP 12091904
GO:0045069 regulation of viral genome replication 小鬼 11250896
GO:0045069 regulation of viral genome replication ISS -
GO:0045069 regulation of viral genome replication 塔斯 7590732
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0005829 cytosol EXP 1560526|15098018
GO:0005576 extracellular region EXP 11943775
GO:0005634 IDA 16780588
GO:0005737 细胞质 IDA 16780588

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
CD99 MIC2 |MIC2X |云 CD99molecule CD99interacts with CypA. BIND 15388255
E2F4 E2F-4 E2F transcription factor 4, p107/p130-binding E2F4 interacts with PPIA enhancer. BIND 15782160
ITK EMT | LYK | MGC126257 | MGC126258 | PSCTK2 IL2-inducible T-cell kinase - HPRD,BioGRID 11830645
JAK2 JTK10 Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase) - HPRD,BioGRID 12668872
PPP3CA CALN | CALNA | CALNA1 | CCN1 | CNA1 | PPP2B protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, alpha isoform - HPRD,BioGRID 12218175
PPP3R1 CALNB1 | CNB | CNB1 protein phosphatase 3 (formerly 2B), regulatory subunit B, alpha isoform - HPRD,BioGRID 12218175
PRLR hPRLrI prolactin receptor - HPRD,BioGRID 12668872
PRR13 DKFZp564J157 | FLJ23818 | TXR1 proline rich 13 两个杂交 BioGRID 16189514
PRSS23 MGC5107 | SIG13 | SPUVE | ZSIG13 蛋白酶,丝氨酸,23 两个杂交 BioGRID 16169070
RB1 OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 retinoblastoma 1 RB与CYPA相互作用。 BIND 12210730
S100A8 60B8AG | CAGA | CFAG | CGLA | CP-10 | L1Ag | MA387 | MIF | MRP8 | NIF | P8 S100 calcium binding protein A8 两个杂交 BioGRID 16169070


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
BIOCARTA IL2RB PATHWAY 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME BASIGIN INTERACTIONS 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HIV INFECTION 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期 125 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期的早期阶段 21 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 6HR UP 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP UP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼黑色素瘤复发 61 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI LARGE PRE BII LYMPHOCYTE UP 86 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA复制基因 147 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZUCCHI METASTASIS UP 43 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC和多能祖先 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA MYELOID DIFFERENTIATION UP 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRACHAT RESPONSE TO METHOTREXATE DN 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX UP 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vietor ifrd1目标 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING NEOCORTEX UP 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brachat对Camptothecin DN的反应 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧癌 83 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TUMOR INVASIVENESS UP 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEDDEN LUNG CANCER POOR SURVIVAL A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG MYC TARGETS UP 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍少突细胞麻木ER CORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS DURATION CORR DN 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAO BOUND BY SALL4 ISOFORM B 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上 146 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLEMAN ASPARAGINASE RESISTANCE ALL DN 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因