Gene Page:PPIA
概括?
GeneID | 5478 |
Symbol | PPIA |
Synonyms | CYPA | Cyph | Hel-S-69p |
描述 | peptidylprolyl isomerase A |
参考 | MIM:123840|HGNC:HGNC:9253|Ensembl:ENSG00000196262|HPRD:00457|HPRD:17376|Vega:OTTHUMG00000023687 |
Gene type | protein-coding |
Map location | 7p13 |
Pascal p-value | 0.001 |
Fetal beta | 0.521 |
eGene | Meta |
Support | RNA AND PROTEIN SYNTHESIS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
Gene set name | Method of gene set | 描述 | Info |
---|---|---|---|
CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | Click to show details |
Network | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | Contribution to shortest path in PPI network: 0.1128 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![Not available](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPIA_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
Top 10 positively co-expressed genes | ||
Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
PRKCZ | 0.79 | 0.77 |
MRPS9 | 0.79 | 0.75 |
YARS | 0.78 | 0.76 |
UQCC | 0.77 | 0.79 |
MRPL18 | 0.77 | 0.73 |
DNAJC7 | 0.77 | 0.73 |
NUDT9 | 0.76 | 0.73 |
BECN1 | 0.76 | 0.73 |
ARF3 | 0.75 | 0.80 |
atp6v1d | 0.75 | 0.82 |
Top 10 negatively co-expressed genes | ||
Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
AF347015.18 | -0.53 | -0.20 |
AF347015.2 | -0.49 | -0.23 |
AF347015.21 | -0.49 | -0.16 |
AF347015.26 | -0.46 | -0.21 |
AF347015.8 | -0.45 | -0.21 |
MT-CO2 | -0.45 | -0.22 |
AF347015.15 | -0.43 | -0.23 |
AF347015.31 | -0.43 | -0.23 |
MYLK2 | -0.42 | -0.40 |
NOSTRIN | -0.42 | -0.20 |
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003755 | 肽酰 - 丙酰基传播异构酶活性 | IEA | - | |
GO:0016853 | isomerase activity | IEA | - | |
GO:0042277 | 肽结合 | IEA | - | |
GO:0051082 | unfolded protein binding | 塔斯 | 2644542 | |
GO:0046790 | virion binding | NAS | 11250896 | |
Biological process | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0006457 | protein folding | IEA | - | |
GO:0006457 | protein folding | 塔斯 | 2179953|2644542 | |
GO:0019047 | 探测活动的整合 | EXP | 16291214 | |
GO:0019059 | initiation of viral infection | EXP | 12091904 | |
GO:0045069 | regulation of viral genome replication | 小鬼 | 11250896 | |
GO:0045069 | regulation of viral genome replication | ISS | - | |
GO:0045069 | regulation of viral genome replication | 塔斯 | 7590732 | |
GO:0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
细胞分量 | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
去:0005829 | cytosol | EXP | 1560526|15098018 | |
GO:0005576 | extracellular region | EXP | 11943775 | |
GO:0005634 | 核 | IDA | 16780588 | |
GO:0005737 | 细胞质 | IDA | 16780588 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CD99 | MIC2 |MIC2X |云 | CD99molecule | CD99interacts with CypA. | BIND | 15388255 |
E2F4 | E2F-4 | E2F transcription factor 4, p107/p130-binding | E2F4 interacts with PPIA enhancer. | BIND | 15782160 |
ITK | EMT | LYK | MGC126257 | MGC126258 | PSCTK2 | IL2-inducible T-cell kinase | - | HPRD,BioGRID | 11830645 |
JAK2 | JTK10 | Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase) | - | HPRD,BioGRID | 12668872 |
PPP3CA | CALN | CALNA | CALNA1 | CCN1 | CNA1 | PPP2B | protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, alpha isoform | - | HPRD,BioGRID | 12218175 |
PPP3R1 | CALNB1 | CNB | CNB1 | protein phosphatase 3 (formerly 2B), regulatory subunit B, alpha isoform | - | HPRD,BioGRID | 12218175 |
PRLR | hPRLrI | prolactin receptor | - | HPRD,BioGRID | 12668872 |
PRR13 | DKFZp564J157 | FLJ23818 | TXR1 | proline rich 13 | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
PRSS23 | MGC5107 | SIG13 | SPUVE | ZSIG13 | 蛋白酶,丝氨酸,23 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
RB1 | OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 | retinoblastoma 1 | RB与CYPA相互作用。 | BIND | 12210730 |
S100A8 | 60B8AG | CAGA | CFAG | CGLA | CP-10 | L1Ag | MA387 | MIF | MRP8 | NIF | P8 | S100 calcium binding protein A8 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
BIOCARTA IL2RB PATHWAY | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME BASIGIN INTERACTIONS | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME HEMOSTASIS | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME HIV INFECTION | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期的早期阶段 | 21 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HORIUCHI WTAP TARGETS DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 6HR UP | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP UP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼黑色素瘤复发 | 61 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BENPORATH MYC MAX TARGETS | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MORI LARGE PRE BII LYMPHOCYTE UP | 86 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZUCCHI METASTASIS UP | 43 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC和多能祖先 | 50 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MA MYELOID DIFFERENTIATION UP | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRACHAT RESPONSE TO METHOTREXATE DN | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX UP | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vietor ifrd1目标 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE AGING NEOCORTEX UP | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brachat对Camptothecin DN的反应 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRADE COLON CANCER UP | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WANG TUMOR INVASIVENESS UP | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SHEDDEN LUNG CANCER POOR SURVIVAL A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO HOUSEKEEPING GENES | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG MYC TARGETS UP | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG BOUND BY MYC | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金所有障碍少突细胞麻木ER CORR UP | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM ALL DISORDERS DURATION CORR DN | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RAO BOUND BY SALL4 ISOFORM B | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
因宗乳腺干细胞向上 | 146 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOLLEMAN ASPARAGINASE RESISTANCE ALL DN | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |