基因页面:KCTD9
总结吗?
| GeneID | 54793年 |
| 象征 | KCTD9 |
| 同义词 | BTBD27 |
| 描述 | 钾通道tetramerization域包含9个 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 22401|运用:ENSG00000104756|HPRD: 13772|织女:OTTHUMG00000099428 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 p21.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.817 |
| 夏洛克假定值 | 0.775 |
| 胎儿β | -1.097 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.031 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.00057 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03086 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg07149772 | 8 | 25314972 | KCTD9 | 0.009 | 2.546 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs5990879 | chrX | 20517507 | KCTD9 | 54793年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005249 | 电压门控钾离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006813 | 钾离子运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008076 | 电压门控钾通道复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN中脑标记 | 82年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受E2F4如果 | 728年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 安布罗西尼FLAVOPIRIDOL治疗TP53 | 109年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G2 | 182年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 153 | 1455年 | 1461年 | 1 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA | ||||
| mir - 203.1 | 1647年 | 1653年 | 1 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
| mir - 217 | 412年 | 419年 | 1、m8 | hsa - mir - 217 | UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU |
| mir - 218 | 374年 | 381年 | 1、m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| mir - 320 | 481年 | 487年 | 1 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
| mir - 431 | 1575年 | 1581年 | 1 | hsa - mir - 431 | UGUCUUGCAGGCCGUCAUGCA |
| mir - 448 | 383年 | 390年 | 1、m8 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU | ||||