基因页：gatad2a

概括？
基因 54815
象征 gatad2a
同义词 p66alpha
描述 含有2A的GATA锌指域
参考 MIM：614997|HGNC：HGNC：29989|Ensembl：ENSG00000167491|HPRD：11741|Vega：Otthumg00000152541
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.11
Pascal P值 3.355e-8
Sherlock P值 0.449
胎儿β 0.332
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历：RIPKE_2013 全基因组协会研究 多阶段GWA，瑞典人口和PGC2。24个领先的SNP
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
LK：是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS2905426 CHR19 19478022 TG 6.921E-9 基因间 Mau2，Gatad2a dist = 8459; dist = 18620

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG19239278 19 19513162 gatad2a 6.29e-5 0.402 0.023 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10962066 Chr9 15555037 gatad2a 54815 0.12 反式
RS10962070 Chr9 15566016 gatad2a 54815 0.13 反式
RS10481557 Chr9 15604745 gatad2a 54815 0.07 反式
RS4741528 Chr9 15655977 gatad2a 54815 0.05 反式
RS6474944 Chr9 15670444 gatad2a 54815 0.08 反式
RS6474952 Chr9 15711233 gatad2a 54815 0.12 反式
RS10810439 Chr9 15754392 gatad2a 54815 0.1 反式
RS4146291 Chr9 15783265 gatad2a 54815 0.05 反式
RS10756704 Chr9 15783815 gatad2a 54815 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID HDAC Classi途径 66 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘普通癌基因 79 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关 100 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 128 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL顺式 65 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bernard PPAPDC1B目标DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因