基因页：NDE1
概括？
| 基因 | 54820 |
| 象征 | NDE1 |
| 同义词 | hom-tes-87 | lis4 | mhac | nde | nude | nude1 |
| 描述 | 裸神经发育蛋白1 |
| 参考 | MIM：609449|HGNC：HGNC：17619|Ensembl：ENSG0000000072864|HPRD：14815|Vega：Otthumg00000129885 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p13.11 |
| Pascal P值 | 0.041 |
| Sherlock P值 | 0.436 |
| 胎儿β | -0.127 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4499605 | CHR3 | 108594184 | NDE1 | 54820 | 0.11 | 反式 | ||
| RS16930988 | CHR8 | 65165644 | NDE1 | 54820 | 0.1 | 反式 | ||
| RS11656351 | CHR17 | 9489574 | NDE1 | 54820 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16682949 | |
| 去：0008017 | 微管结合 | ISS | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突（GO期限：5） | - |
| 去：0007049 | 细胞周期 | IEA | - | |
| 去：0007067 | 有丝分裂 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| GO：0051298 | 中心体重复 | ISS | - | |
| 去：0051301 | 细胞分裂 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0000777 | 凝结的染色体动力学 | IEA | - | |
| 去：0005819 | 主轴 | IEA | - | |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
| 去：0005874 | 微管 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| GO：0031616 | 主轴杆中心体 | ISS | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Scibetta KDM5B靶向 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ETS1和SP100 UP的Yordy倒数调节 | 25 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 仅通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB目标 | 74 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tseng irs1靶向 | 113 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jiang Tip30目标 | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集9 | 35 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-28 | 544 | 550 | M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |