概括
基因 54826
象征 gin1
同义词 gin-1 | tgin1 | zh2c2
描述 吉普赛逆转座子整合酶1
参考 HGNC:HGNC:25959|ENSEMBL:ENSG00000145723|HPRD:07878|Vega:Otthumg00000162811
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q21.1
Pascal P值 0.324
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG05452345 5 102455768 gin1 2.97E-8 0.006 9.11E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MON1A 0.86 0.81
MCAT 0.86 0.82
APBB1 0.85 0.84
TBRG4 0.85 0.82
RTN2 0.84 0.82
McOLN1 0.84 0.85
PRAF2 0.84 0.85
PPP5C 0.83 0.82
rabggta 0.83 0.81
STK25 0.83 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.8 -0.65 -0.56
AF347015.26 -0.64 -0.57
AF347015.2 -0.63 -0.54
AL139819.3 -0.62 -0.62
AF347015.33 -0.62 -0.54
AF347015.18 -0.62 -0.63
MT-CO2 -0.62 -0.51
AF347015.15 -0.61 -0.51
mt-cyb -0.61 -0.52
MT-ATP8 -0.61 -0.57

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因