基因页:gin1
概括?
基因 | 54826 |
象征 | gin1 |
同义词 | gin-1 | tgin1 | zh2c2 |
描述 | 吉普赛逆转座子整合酶1 |
参考 | HGNC:HGNC:25959|ENSEMBL:ENSG00000145723|HPRD:07878|Vega:Otthumg00000162811 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q21.1 |
Pascal P值 | 0.324 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG05452345 | 5 | 102455768 | gin1 | 2.97E-8 | 0.006 | 9.11E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MON1A | 0.86 | 0.81 |
MCAT | 0.86 | 0.82 |
APBB1 | 0.85 | 0.84 |
TBRG4 | 0.85 | 0.82 |
RTN2 | 0.84 | 0.82 |
McOLN1 | 0.84 | 0.85 |
PRAF2 | 0.84 | 0.85 |
PPP5C | 0.83 | 0.82 |
rabggta | 0.83 | 0.81 |
STK25 | 0.83 | 0.78 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.8 | -0.65 | -0.56 |
AF347015.26 | -0.64 | -0.57 |
AF347015.2 | -0.63 | -0.54 |
AL139819.3 | -0.62 | -0.62 |
AF347015.33 | -0.62 | -0.54 |
AF347015.18 | -0.62 | -0.63 |
MT-CO2 | -0.62 | -0.51 |
AF347015.15 | -0.61 | -0.51 |
mt-cyb | -0.61 | -0.52 |
MT-ATP8 | -0.61 | -0.57 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |