基因页面:BCAS3
总结吗?
GeneID | 54828年 |
象征 | BCAS3 |
同义词 | GAOB1 | MAAB |
描述 | 乳腺癌扩增序列3 |
参考 | MIM: 607470|HGNC: HGNC: 14347|运用:ENSG00000141376|HPRD: 06313|织女:OTTHUMG00000180064 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 17 q23处 |
帕斯卡假定值 | 0.067 |
夏洛克假定值 | 0.235 |
胎儿β | -0.891 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg22375853 | 17 | 58928702 | BCAS3 | 6.71 e-5 | 0.392 | 0.024 | DMG: Wockner_2014 |
cg03821916 | 17 | 58755215 | BCAS3 | 5.268的军医 | -0.592 | 0.048 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BCAS3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MIF | 0.89 | 0.89 |
MRPS12 | 0.89 | 0.87 |
STOML2 | 0.89 | 0.87 |
C11orf31 | 0.88 | 0.82 |
CHCHD2 | 0.88 | 0.87 |
MRPL12 | 0.88 | 0.82 |
MRPL17 | 0.88 | 0.85 |
MRPL14 | 0.88 | 0.78 |
英里/加仑 | 0.88 | 0.79 |
COX8A | 0.87 | 0.85 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC010300.1 | -0.46 | -0.60 |
EIF5B | -0.45 | -0.58 |
AP000769.2 | -0.45 | -0.52 |
AF347015.18 | -0.43 | -0.37 |
Z83840.4 | -0.42 | -0.42 |
AC016705.1 | -0.40 | -0.40 |
AC005921.3 | -0.40 | -0.58 |
MALAT1 | -0.39 | -0.42 |
SFRS18 | -0.39 | -0.52 |
C10orf108 | -0.38 | -0.38 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌17 Q25对方篮里扩增子 | 335年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC MYC目标 | 217年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOCHKIS FOXA2目标 | 425年 | 261年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YAUCH刺猬信号旁分泌 | 149年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TORCHIA EWSR1 FLI1融合的目标 | 271年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT核心少突细胞分化 | 40 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |