基因页：BIVM
概括？
| 基因 | 54841 |
| 象征 | BIVM |
| 同义词 | - |
| 描述 | 基本的，免疫球蛋白样变量基序 |
| 参考 | HGNC：HGNC：16034|ENSEMBL：ENSG00000134897|HPRD：09827|Vega：Otthumg0000000017309 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q33.1 |
| Pascal P值 | 0.385 |
| Sherlock P值 | 0.346 |
| 胎儿β | 1.139 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18247638 | 13 | 103451366 | BIVM | -0.021 | 0.43 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1536378 | CHR13 | 103472268 | BIVM | 54841 | 0.05 | 顺式 | ||
| RS12405921 | CHR1 | 206695730 | BIVM | 54841 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC25A39 | 0.90 | 0.87 |
| 彭 | 0.85 | 0.81 |
| GSTP1 | 0.85 | 0.79 |
| 应付 | 0.84 | 0.84 |
| GPS1 | 0.83 | 0.81 |
| SF3B5 | 0.83 | 0.81 |
| TARBP2 | 0.81 | 0.78 |
| mpdu1 | 0.81 | 0.80 |
| AKR1A1 | 0.81 | 0.80 |
| flad1 | 0.81 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.53 | -0.59 |
| AF347015.8 | -0.52 | -0.58 |
| MT-ATP8 | -0.52 | -0.64 |
| AF347015.15 | -0.51 | -0.58 |
| AF347015.33 | -0.51 | -0.58 |
| AF347015.26 | -0.51 | -0.59 |
| mt-cyb | -0.50 | -0.58 |
| MT-CO2 | -0.49 | -0.54 |
| AF347015.2 | -0.49 | -0.56 |
| AF347015.31 | -0.48 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-146 | 132 | 138 | M8 | HSA-MIR-146A | ugagaacugaauuccaugggug |
| HSA-MIR-146B脑 | ugagaacugaauuccauaggcu | ||||
| mir-28 | 1254 | 1260 | M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |
| mir-495 | 1603 | 1609年 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |