基因页:def8
概括?
基因 | 54849 |
象征 | def8 |
同义词 | - |
描述 | 在FDCP 8同源物(鼠标)中差异表达 |
参考 | HGNC:HGNC:25969|ENSEMBL:ENSG00000140995|HPRD:07882|Vega:Otthumg00000138989 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q24.3 |
Pascal P值 | 0.029 |
Sherlock P值 | 0.744 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7195043 | CHR16 | 90020860 | def8 | 54849 | 0.08 | 顺式 | ||
RS8063761 | CHR16 | 90027625 | def8 | 54849 | 0.15 | 顺式 | ||
RS17178299 | CHR16 | 90103658 | def8 | 54849 | 0.13 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DEF8_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
XRCC6 | 0.92 | 0.93 |
SF3A3 | 0.91 | 0.91 |
mki67ip | 0.91 | 0.93 |
CPSF3 | 0.91 | 0.93 |
VPS45 | 0.90 | 0.90 |
dnttip2 | 0.90 | 0.91 |
UTP11L | 0.90 | 0.89 |
PLRG1 | 0.90 | 0.90 |
TAF7 | 0.90 | 0.92 |
SFRS3 | 0.90 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.78 | -0.81 |
AF347015.33 | -0.78 | -0.83 |
AF347015.8 | -0.77 | -0.81 |
mt-cyb | -0.77 | -0.81 |
AF347015.27 | -0.76 | -0.80 |
AF347015.2 | -0.75 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.80 |
AF347015.15 | -0.75 | -0.81 |
AF347015.26 | -0.72 | -0.78 |
AF347015.9 | -0.72 | -0.80 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roylance乳腺癌16Q复制号码 | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |