概括
基因 54849
象征 def8
同义词 -
描述 在FDCP 8同源物(鼠标)中差异表达
参考 HGNC:HGNC:25969|ENSEMBL:ENSG00000140995|HPRD:07882|Vega:Otthumg00000138989
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q24.3
Pascal P值 0.029
Sherlock P值 0.744
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7195043 CHR16 90020860 def8 54849 0.08 顺式
RS8063761 CHR16 90027625 def8 54849 0.15 顺式
RS17178299 CHR16 90103658 def8 54849 0.13 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
XRCC6 0.92 0.93
SF3A3 0.91 0.91
mki67ip 0.91 0.93
CPSF3 0.91 0.93
VPS45 0.90 0.90
dnttip2 0.90 0.91
UTP11L 0.90 0.89
PLRG1 0.90 0.90
TAF7 0.90 0.92
SFRS3 0.90 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.78 -0.81
AF347015.33 -0.78 -0.83
AF347015.8 -0.77 -0.81
mt-cyb -0.77 -0.81
AF347015.27 -0.76 -0.80
AF347015.2 -0.75 -0.81
AF347015.31 -0.75 -0.80
AF347015.15 -0.75 -0.81
AF347015.26 -0.72 -0.78
AF347015.9 -0.72 -0.80

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roylance乳腺癌16Q复制号码 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon 53 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因