概括
基因 54858
象征 PGPEP1
同义词 pap-i | pgp | pgp-i | pgpi | pcp
描述 昆丁酰肽酶I。
参考 MIM:610694|HGNC:HGNC:13568|Ensembl:ENSG00000130517|HPRD:07141|Vega:Otthumg00000183358
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.11
Pascal P值 0.186
胎儿β 0.573
主持人 尾状基底神经节
皮质
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.664

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17714461 CHR19 51425105 PGPEP1 54858 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO28 0.85 0.86
Hint3 0.84 0.84
DDHD1 0.84 0.83
Btrc 0.83 0.84
Appl1 0.83 0.85
hif1an 0.83 0.82
arcn1 0.82 0.81
AKAP10 0.82 0.83
pafah1b1 0.82 0.83
NAT13 0.82 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.67 -0.60
MT-CO2 -0.66 -0.62
FXYD1 -0.66 -0.62
AF347015.31 -0.64 -0.61
higd1b -0.63 -0.61
AF347015.8 -0.63 -0.60
mt-cyb -0.62 -0.58
AF347015.33 -0.62 -0.57
AC098691.2 -0.61 -0.58
ifi27 -0.60 -0.58

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008234 半胱氨酸型肽酶活性 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN 98 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lein脉络丛标记 103 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zembutsu对顺铂的敏感性 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zembutsu对长春新碱的敏感性 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix RAR目标 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-151 5127 5133 1a HSA-MIR-151 Acuagacugaagcucuugagg