基因页面:CC2D1A
总结吗?
GeneID | 54862年 |
象征 | CC2D1A |
同义词 | FREUD-1 | FREUD-1 / Aki1 | MRT3 |
描述 | 包含1卷曲螺旋和C2域 |
参考 | MIM: 610055|HGNC: HGNC: 30237|运用:ENSG00000132024|HPRD: 08616|织女:OTTHUMG00000181852 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 p13.12 |
帕斯卡假定值 | 0.72 |
夏洛克假定值 | 0.002 |
胎儿β | -0.25 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | CompositeSet Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg14269716 | 19 | 14016603 | C19orf57; CC2D1A | 2.44的军医 | 0.301 | 0.037 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs17220846 | chr10 | 64187530 | CC2D1A | 54862年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CC2D1A_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ADSL | 0.86 | 0.90 |
RPL26L1 | 0.85 | 0.87 |
NSMCE1 | 0.84 | 0.78 |
SNRPC | 0.83 | 0.88 |
PSMA7 | 0.83 | 0.86 |
COQ5 | 0.83 | 0.83 |
TSTA3 | 0.83 | 0.85 |
RFC2 | 0.83 | 0.86 |
PPIL1 | 0.82 | 0.88 |
VPS25 | 0.82 | 0.82 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.26 | -0.64 | -0.78 |
AF347015.8 | -0.64 | -0.75 |
MT-CYB | -0.64 | -0.75 |
MT-CO2 | -0.64 | -0.72 |
AF347015.15 | -0.64 | -0.76 |
AF347015.2 | -0.63 | -0.75 |
AF347015.27 | -0.63 | -0.74 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.73 |
AF347015.31 | -0.62 | -0.71 |
AF347015.9 | -0.57 | -0.70 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WAMUNYOKOLI卵巢癌LMP | 265年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的喀斯特DN的目标 | 66年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
江缺氧正常 | 311年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森受E2F4如果 | 728年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
安布罗西尼FLAVOPIRIDOL治疗TP53 | 109年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
丰田MIR34B和MIR34C的目标 | 463年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
经典VERHAAK胶质母细胞瘤 | 162年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |